RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.73■□□□□ 0.59
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PTPRU-209ENST00000526080 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 MASTLQ96GX5 879 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
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PTPRU-209ENST00000526080 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.69■□□□□ 0.58
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PTPRU-209ENST00000526080 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRU-209ENST00000526080 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
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PTPRU-209ENST00000526080 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.66■□□□□ 0.58
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PTPRU-209ENST00000526080 NPR1P16066 1061 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 AIDAQ96BJ3 306 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 HACL1Q9UJ83 578 aa18.64■□□□□ 0.57
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PTPRU-209ENST00000526080 NPHP1O15259 732 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 OLFM4Q6UX06 510 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 USP16Q9Y5T5 823 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 EPHX2P34913 555 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 LBX1P52954 281 aa18.62■□□□□ 0.57
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PTPRU-209ENST00000526080 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 COL4A5P29400 1685 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRU-209ENST00000526080 LTBP1Q14766 1721 aa18.62■□□□□ 0.57
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PTPRU-209ENST00000526080 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.59■□□□□ 0.57
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PTPRU-209ENST00000526080 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 ABHD8Q96I13 439 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 PSMD1Q99460 953 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
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PTPRU-209ENST00000526080 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
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PTPRU-209ENST00000526080 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 HLFQ16534 295 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 SCNN1DP51172 638 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 FAM161AQ3B820 660 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRU-209ENST00000526080 MCM10Q7L590 875 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRU-209ENST00000526080 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRU-209ENST00000526080 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRU-209ENST00000526080 FAM177BA6PVY3 158 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRU-209ENST00000526080 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
PTPRU-209ENST00000526080 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRU-209ENST00000526080 JDP2Q8WYK2 163 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRU-209ENST00000526080 NUP98P52948 1817 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-209ENST00000526080 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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