RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525809.5

BBS1-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 601 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-208	ENST00000525809	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	NPR1	P16066	1061 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	RALBP1	Q15311	655 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	HLF	Q16534	295 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-208	ENST00000525809	RIPK4	P57078	832 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	CCDC93	Q567U6	631 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	POTEC	B2RU33	542 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	MYL6B	P14649	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	HTRA3	P83110	453 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	GPT	P24298	496 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-208	ENST00000525809	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	PDIA6	Q15084	440 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	PSMD1	Q99460	953 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	FZD9	O00144	591 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	CHL1	O00533	1208 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	NTSR2	O95665	410 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	ANXA1	P04083	346 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-208	ENST00000525809	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25

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