RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 CAMTA2O94983 1202 aa23.93■■□□□ 1.42
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PTPRK-218ENST00000525459 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
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PTPRK-218ENST00000525459 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRK-218ENST00000525459 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.82■■□□□ 1.4
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PTPRK-218ENST00000525459 NLRP10Q86W26 655 aa23.73■■□□□ 1.39
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PTPRK-218ENST00000525459 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 CNBD1Q8NA66 436 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 F6X3S4 739 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 NPHP1O15259 732 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 MS4A1P11836 297 aa23.72■■□□□ 1.39
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