RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 IGF1RP08069 1367 aa8.5□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 PRMT3O60678 531 aa8.5□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.5□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 SVOPQ8N4V2 548 aa8.5□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.5□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 FGFR3P22607 806 aa8.49□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.49□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.49□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 KLRG1Q96E93 195 aa8.49□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 SLURP2P0DP57 97 aa8.48□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 BMP4P12644 408 aa8.48□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.48□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.48□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 WHAMMQ8TF30 809 aa8.48□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.48□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 WEE1P30291 646 aa8.47□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 CTBSQ01459 385 aa8.47□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 POTEAQ6S8J7 498 aa8.47□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.47□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 FOXO3O43524 673 aa8.46□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 CD33P20138 364 aa8.46□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 TNP2Q05952 138 aa8.46□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.46□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.46□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.46□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 MAP2K3P46734 347 aa8.45□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 MAP3K10Q02779 954 aa8.45□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.45□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.45□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 SUSD3Q96L08 255 aa8.45□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 CEP63Q96MT8 703 aa8.45□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 C2CD2LO14523 706 aa8.44□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 FAM157BP0CG42 384 aa8.44□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.44□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 ACDQ96AP0 544 aa8.44□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.44□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 RTN1Q16799 776 aa8.43□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 MARK1Q9P0L2 795 aa8.43□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 HIF1AQ16665 826 aa8.42□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.42□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 BRD7Q9NPI1 651 aa8.42□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 STRN4Q9NRL3 753 aa8.42□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 KLK14Q9P0G3 267 aa8.42□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 HCN2Q9UL51 889 aa8.42□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 BCRP11274 1271 aa8.41□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 DGKZQ13574 1117 aa8.41□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 OCLNQ16625 522 aa8.41□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.41□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 EFSO43281 561 aa8.4□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.4□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.4□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CPEB4-210ENST00000522344 GDF11O95390 407 aa8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 ATP2B4P23634 1241 aa8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 RASSF7Q02833 373 aa8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 TYRO3Q06418 890 aa8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 LAMC2Q13753 1193 aa8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 GRIN2CQ14957 1233 aa8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 GGA1Q9UJY5 639 aa8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 CARNS1A5YM72 827 aa8.38□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.38□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 FAM182BQ5T319 152 aa8.38□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.38□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.38□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.38□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.37□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 ARHGEF15O94989 841 aa8.37□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.37□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 SLAIN2Q9P270 581 aa8.37□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.37□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.37□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 BCS1LQ9Y276 419 aa8.37□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 OIP5O43482 229 aa8.36□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 ARAFP10398 606 aa8.36□□□□□ -1.07
CPEB4-210ENST00000522344 COX20Q5RI15 118 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms