RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519106.1

CLDN23-201, Transcript of claudin 23, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN23, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23-201ENST00000519106 GNAI2P04899 355 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 ITPK1Q13572 414 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 MYD88Q99836 296 aa26.18■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.18■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 BTAF1O14981 1849 aa26.18■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 ALDH1L1O75891 902 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 SBF2Q86WG5 1849 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 IGKV5-2P06315 115 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 ARXQ96QS3 562 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 RXRBP28702 533 aa26.16■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 CEP85Q6P2H3 762 aa26.16■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 KCNQ4P56696 695 aa26.16■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.15■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.14■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.14■■□□□ 1.78
CLDN23-201ENST00000519106 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.12■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 GRM8O00222 908 aa26.1■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 GCKRQ14397 625 aa26.1■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 SMC5Q8IY18 1101 aa26.1■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.09■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.09■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 POTEAQ6S8J7 498 aa26.09■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.09■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 TRIM37O94972 964 aa26.08■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 RGS3P49796 1198 aa26.08■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CLDN23-201ENST00000519106 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 GCC1Q96CN9 775 aa26.07■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.07■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.07■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 ATP8B2P98198 1209 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 HMMRO75330 724 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 UTYO14607 1347 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 HLFQ16534 295 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 DCTPP1Q9H773 170 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 A0A087WZG4 1122 aa26.03■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 TCIRG1Q13488 830 aa26.03■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.03■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.03■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.02■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.02■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 SUCLG2Q96I99 432 aa26.02■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 NUCB1Q02818 461 aa26.02■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 RREB1Q92766 1687 aa26.01■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 LY75O60449 1722 aa26.01■■□□□ 1.76
CLDN23-201ENST00000519106 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.01■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 KAZALD1Q96I82 304 aa26■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 SRGAP3O43295 1099 aa26■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 ISCA1Q9BUE6 129 aa26■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.99■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.99■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.99■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 LNPKQ9C0E8 428 aa25.99■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 APBB1O00213 710 aa25.98■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 COL15A1P39059 1388 aa25.98■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 GPTP24298 496 aa25.97■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 SSH3Q8TE77 659 aa25.97■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 SMIM5Q71RC9 77 aa25.97■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.97■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.97■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.96■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 H7C1W4 665 aa25.96■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 NUP98P52948 1817 aa25.96■■□□□ 1.75
CLDN23-201ENST00000519106 GNPATO15228 680 aa25.95■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 CASP7P55210 303 aa25.95■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 POLA2Q14181 598 aa25.95■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.95■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 PDE4AP27815 886 aa25.95■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 MTX1Q13505 466 aa25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 252 ms