RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 IGSF3O75054 1194 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 SDSP20132 328 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 ATP8B2P98198 1209 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 TTC22Q5TAA0 569 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF5Q96JK2 942 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 AKAP12Q02952 1782 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 PHKG2P15735 406 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 KSR2Q6VAB6 950 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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TRPS1-208ENST00000519076 ESPNB1AK53 854 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 PDE1AP54750 535 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 ST18O60284 1047 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-208ENST00000519076 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-208ENST00000519076 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-208ENST00000519076 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-208ENST00000519076 ERC2O15083 957 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 AACSQ86V21 672 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WZG4 1122 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 GRM8O00222 908 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 CYP27B1O15528 508 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 GORABQ5T7V8 394 aa9.46□□□□□ -0.89
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TRPS1-208ENST00000519076 LINS1Q8NG48 757 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 NEUROD6Q96NK8 337 aa9.46□□□□□ -0.89
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TRPS1-208ENST00000519076 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 FAM177BA6PVY3 158 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 NEK4P51957 841 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 CNTROBQ8N137 903 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
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TRPS1-208ENST00000519076 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 RAB11FIP3O75154 756 aa9.45□□□□□ -0.9
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TRPS1-208ENST00000519076 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
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TRPS1-208ENST00000519076 ALDH1L1O75891 902 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 YY1AP1Q9H869 796 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.44□□□□□ -0.9
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TRPS1-208ENST00000519076 A1BGP04217 495 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 KLHDC4Q8TBB5 520 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 MST1RQ04912 1400 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 RABEP1Q15276 862 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.43□□□□□ -0.9
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TRPS1-208ENST00000519076 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 NPHP1O15259 732 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 GBP4Q96PP9 640 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 FSD1Q9BTV5 496 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 PSMD1Q99460 953 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 GPTP24298 496 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 STARD3NLO95772 234 aa9.42□□□□□ -0.9
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