RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 C8orf37Q96NL8 207 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 SETDB2Q96T68 719 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF19AQ9NV58 838 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 TXLNAP40222 546 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP2B2Q01814 1243 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 TMC4Q7Z404 712 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 LDLRAD1Q5T700 205 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 TREML1Q86YW5 311 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 MRS2Q9HD23 443 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G4AP47712 749 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 DAB2P98082 770 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 GNASQ5JWF2 1037 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 MEIOBQ8N635 442 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 GRIP2Q9C0E4 1043 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 BCS1LQ9Y276 419 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 GPC1P35052 558 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR152Q8TDT2 470 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SORBS3O60504 671 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMD2Q13200 908 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 C4orf17Q53FE4 359 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PCSK2P16519 638 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ITGAEP38570 1179 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ALG1LQ6GMV1 187 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP4X1Q8N118 509 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 RHPN1Q8TCX5 695 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 GDF9O60383 454 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 VTI1BQ9UEU0 232 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SMPD1P17405 629 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 ORC1Q13415 861 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 C9orf131Q5VYM1 1079 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM87AQ8NBN3 555 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 C7orf43Q8WVR3 580 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 CSRNP1Q96S65 589 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 TOR4AQ9NXH8 423 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 TGFBR3LH3BV60 316 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFRSF10AO00220 468 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 MICAL2O94851 1124 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 NBPF1Q3BBV0 1214 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 C8orf34Q49A92 452 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM13BQ9NYF5 915 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 A6NHS1 94 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 HIF1AQ16665 826 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 AIDAQ96BJ3 306 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 KLRG1Q96E93 195 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A0G2JS52 829 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 GNA15P30679 374 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 NAALADL2Q58DX5 795 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 TTC16Q8NEE8 873 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 FBF1Q8TES7 1133 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 SPINT1O43278 529 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 PHKA2P46019 1235 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 PIK3R5Q8WYR1 880 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 SUSD3Q96L08 255 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 OPLAHO14841 1288 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF280CQ8ND82 737 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 HPS1Q92902 700 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 HSH2DQ96JZ2 352 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 DRC1Q96MC2 740 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 FANCCQ00597 558 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 IER5Q5VY09 327 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJC25Q9H1X3 360 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 NEFLP07196 543 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 IDH3AP50213 366 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 NT5DC4Q86YG4 428 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP4AP20648 1035 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 POU4F2Q12837 409 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 BICDL1Q6ZP65 573 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF34Q969K3 372 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms