RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513542.1

SMAD1-AS1-201, SMAD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMAD1-AS1, Length 481 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 VAMP4O75379 141 aa17.25■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 POLD1P28340 1107 aa17.25■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DDR1Q08345 913 aa17.25■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 XAGE3Q8WTP9 111 aa17.25■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CCDC30Q5VVM6 783 aa17.24■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.24■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NLGN1Q8N2Q7 840 aa17.24■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa17.24■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa17.23■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NFIXQ14938 502 aa17.23■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HLFQ16534 295 aa17.23■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TBC1D9BQ66K14 1250 aa17.23■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 COPS6Q7L5N1 327 aa17.23■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZBTB3Q9H5J0 574 aa17.23■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa17.22■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BICDL1Q6ZP65 573 aa17.22■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HYPKQ9NX55 129 aa17.22■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TM4SF1P30408 202 aa17.21■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ATP10DQ9P241 1426 aa17.21■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ERVV-1B6SEH8 477 aa17.2■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STK31Q9BXU1 1019 aa17.2■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF652Q9Y2D9 606 aa17.2■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C10orf71Q711Q0 1435 aa17.2■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CARMIL3Q8ND23 1372 aa17.19■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CLEC4GQ6UXB4 293 aa17.19■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 G2E3Q7L622 706 aa17.19■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KLHL34Q8N239 644 aa17.19■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.19■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PARP3Q9Y6F1 533 aa17.19■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RGL2O15211 777 aa17.18■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLC4A2P04920 1241 aa17.17■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DLEC1Q9Y238 1755 aa17.17■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 UBN2Q6ZU65 1347 aa17.17■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ADCY9O60503 1353 aa17.16■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SERPINB2P05120 415 aa17.16■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GPTP24298 496 aa17.16■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PLBD2Q8NHP8 589 aa17.16■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SETDB2Q96T68 719 aa17.16■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FLIIQ13045 1269 aa17.15■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa17.15■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BCL2L13Q9BXK5 485 aa17.15■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LAMB2P55268 1798 aa17.15■□□□□ 0.34
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CACNA1SQ13698 1873 aa17.14■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF34Q8IZ26 560 aa17.14■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NLGN2Q8NFZ4 835 aa17.14■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SSH1Q8WYL5 1049 aa17.14■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PXDNLA1KZ92 1463 aa17.13■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM177BA6PVY3 158 aa17.13■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PRR5LQ6MZQ0 368 aa17.13■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CCDC24Q8N4L8 307 aa17.13■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SYT17Q9BSW7 474 aa17.13■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TCIRG1Q13488 830 aa17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RIC3Q7Z5B4 369 aa17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CNBD1Q8NA66 436 aa17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF428Q96B54 188 aa17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CD2APQ9Y5K6 639 aa17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ABCC12Q96J65 1359 aa17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PI4KAP2A4QPH2 592 aa17.11■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DDX58O95786 925 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa17.11■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KSR2Q6VAB6 950 aa17.11■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa17.11■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SMC4Q9NTJ3 1288 aa17.11■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa17.1■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NTSR2O95665 410 aa17.1■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ALDH1L2Q3SY69 923 aa17.1■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SUSD4Q5VX71 490 aa17.1■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NLRP10Q86W26 655 aa17.1■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MYD88Q99836 296 aa17.1■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ISCA1Q9BUE6 129 aa17.1■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RARSP54136 660 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NUTM1Q86Y26 1132 aa17.09■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MYH3P11055 1940 aa17.08■□□□□ 0.33
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 F6X3S4 739 aa17.08■□□□□ 0.32
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NPHP1O15259 732 aa17.08■□□□□ 0.32
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PARP10Q53GL7 1025 aa17.08■□□□□ 0.32
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ST5P78524 1137 aa17.07■□□□□ 0.32
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