RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CAMTA2O94983 1202 aa12.43□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CLEC4GQ6UXB4 293 aa12.43□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC24Q8N4L8 307 aa12.43□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IL17REQ8NFR9 667 aa12.43□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIF7Q2M1P5 1343 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BTBD11A6QL63 1104 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A1BGP04217 495 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NPR1P16066 1061 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CNTNAP1P78357 1384 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CFAP53Q96M91 514 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRDM10Q9NQV6 1147 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SCN4AP35499 1836 aa12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM88BA6NKF7 163 aa12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RGL2O15211 777 aa12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TPTE2Q6XPS3 522 aa12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RTKN2Q8IZC4 609 aa12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HACL1Q9UJ83 578 aa12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BCORQ6W2J9 1755 aa12.4□□□□□ -0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLX4Q8IY92 1834 aa12.39□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUDCQ9Y266 331 aa12.39□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PASKQ96RG2 1323 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CACNA1SQ13698 1873 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FOXN1O15353 648 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POTEIP0CG38 1075 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POTEJP0CG39 1038 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ALDH1B1P30837 517 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.38□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRKAR2BP31323 418 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EPHX2P34913 555 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C7orf43Q8WVR3 580 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP16Q9Y5T5 823 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VEGFBP49765 207 aa12.36□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 JDP2Q8WYK2 163 aa12.36□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NYXQ9GZU5 481 aa12.36□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KCNQ3O43525 872 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IARSP41252 1262 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPC2Q8N158 579 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF541Q9H0D2 1346 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NEFMP07197 916 aa12.34□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EIF6P56537 245 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DEFB115Q30KQ5 88 aa12.34□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CNTROBQ8N137 903 aa12.34□□□□□ -0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RASSF10A6NK89 507 aa12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM177BA6PVY3 158 aa12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FZD9O00144 591 aa12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SYNE4Q8N205 404 aa12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PSMD1Q99460 953 aa12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WBP1LQ9NX94 342 aa12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNF123Q5XPI4 1314 aa12.33□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LBX1P52954 281 aa12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MCM10Q7L590 875 aa12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BEGAINQ9BUH8 593 aa12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERVV-1B6SEH8 477 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ECE1P42892 770 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NBPF26B4DH59 902 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CRY2Q49AN0 593 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIF6Q6ZMV9 814 aa12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms