RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-207ENST00000497251 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-207ENST00000497251 C21orf2O43822 256 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRELPP51888 382 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERFEQ4G0M1 354 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 WDR90Q96KV7 1748 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 MCM10Q7L590 875 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 NPR1P16066 1061 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 BCORQ6W2J9 1755 aa22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 POTECB2RU33 542 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC93Q567U6 631 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 NBPF26B4DH59 902 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 ALDH1B1P30837 517 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 NBPF15Q8N660 670 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 DCTN1Q14203 1278 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 NYXQ9GZU5 481 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLX4Q8IY92 1834 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 HTRA3P83110 453 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 CHADLQ6NUI6 762 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 NFE2L2Q16236 605 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERBB4Q15303 1308 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 CRY2Q49AN0 593 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 CREBZFQ9NS37 354 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 PCNTO95613 3336 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 HLFQ16534 295 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 LDHDQ86WU2 507 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 PSMD1Q99460 953 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 SCN4AP35499 1836 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 FZD9O00144 591 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 PARP10Q53GL7 1025 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 JDP2Q8WYK2 163 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 FAM177BA6PVY3 158 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 RALBP1Q15311 655 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 SYNE4Q8N205 404 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 HACL1Q9UJ83 578 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPC2Q8N158 579 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 NGEFQ8N5V2 710 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 VPS33BQ9H267 617 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 CACNA1SQ13698 1873 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 PASKQ96RG2 1323 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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