RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 SLX4Q8IY92 1834 aa28.04■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 POTEIP0CG38 1075 aa28.03■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 POTEJP0CG39 1038 aa28.03■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.01■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 BTBD11A6QL63 1104 aa27.99■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.99■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 CACNA1SQ13698 1873 aa27.98■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 KCNQ3O43525 872 aa27.98■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 LDHDQ86WU2 507 aa27.98■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 CCDC93Q567U6 631 aa27.96■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.96■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.96■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 USP16Q9Y5T5 823 aa27.96■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.96■■■□□ 2.07
NELFE-210ENST00000491139 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.95■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 CNTNAP1P78357 1384 aa27.95■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 PASKQ96RG2 1323 aa27.94■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 BCORQ6W2J9 1755 aa27.94■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 NPR1P16066 1061 aa27.94■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 SCN4AP35499 1836 aa27.94■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.93■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.93■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 FOXN1O15353 648 aa27.91■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 PRKAR2BP31323 418 aa27.91■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.91■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 TMEM88BA6NKF7 163 aa27.9■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.89■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 AIDAQ96BJ3 306 aa27.89■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27.89■■■□□ 2.06
NELFE-210ENST00000491139 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 RTKN2Q8IZC4 609 aa27.88■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 HACL1Q9UJ83 578 aa27.88■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 ZNF541Q9H0D2 1346 aa27.88■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 VEGFBP49765 207 aa27.87■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 CFAP53Q96M91 514 aa27.87■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.87■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.87■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 RGL2O15211 777 aa27.86■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 EPHX2P34913 555 aa27.85■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 OLFM4Q6UX06 510 aa27.85■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 FAM177BA6PVY3 158 aa27.84■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 ALDH1B1P30837 517 aa27.84■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 NBPF26B4DH59 902 aa27.83■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 MCM10Q7L590 875 aa27.83■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 NBPF15Q8N660 670 aa27.83■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 NUDCQ9Y266 331 aa27.83■■■□□ 2.05
NELFE-210ENST00000491139 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 SYNE4Q8N205 404 aa27.82■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 FZD9O00144 591 aa27.81■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 WBP1LQ9NX94 342 aa27.81■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.81■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 CNTROBQ8N137 903 aa27.8■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 GPC2Q8N158 579 aa27.79■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 HLFQ16534 295 aa27.78■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 DEFB115Q30KQ5 88 aa27.78■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 JDP2Q8WYK2 163 aa27.78■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 RASSF10A6NK89 507 aa27.77■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 DCTN1Q14203 1278 aa27.77■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa27.77■■■□□ 2.04
NELFE-210ENST00000491139 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 LBX1P52954 281 aa27.76■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 PSMD1Q99460 953 aa27.76■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.74■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 NYXQ9GZU5 481 aa27.74■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 CRY2Q49AN0 593 aa27.73■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 GJA3Q9Y6H8 435 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.71■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 NGEFQ8N5V2 710 aa27.71■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 SNED1Q8TER0 1413 aa27.7■■■□□ 2.03
NELFE-210ENST00000491139 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.7■■■□□ 2.02
NELFE-210ENST00000491139 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms