RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 RGL2O15211 777 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 CACNA1SQ13698 1873 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 SLX4Q8IY92 1834 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 NPHP1O15259 732 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 C21orf2O43822 256 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 IFFO2Q5TF58 517 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 STYK1Q6J9G0 422 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 CNKSR1Q969H4 720 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 NBPF26B4DH59 902 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 NEFMP07197 916 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 SRGNP10124 158 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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SH3BP4-210ENST00000489601 NBPF15Q8N660 670 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 MASTLQ96GX5 879 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.02■■□□□ 1.11
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SH3BP4-210ENST00000489601 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 MIS18AQ9NYP9 233 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 SOGA3Q5TF21 947 aa21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP4-210ENST00000489601 ERFEQ4G0M1 354 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.98■■□□□ 1.11
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SH3BP4-210ENST00000489601 KLRG1Q96E93 195 aa21.97■■□□□ 1.11
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SH3BP4-210ENST00000489601 POTECB2RU33 542 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 HTRA3P83110 453 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 NFE2L2Q16236 605 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 NUP98P52948 1817 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-210ENST00000489601 NPR1P16066 1061 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-210ENST00000489601 HLFQ16534 295 aa21.95■■□□□ 1.1
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SH3BP4-210ENST00000489601 JMYQ8N9B5 988 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-210ENST00000489601 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC93Q567U6 631 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM177BA6PVY3 158 aa21.9■■□□□ 1.1
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SH3BP4-210ENST00000489601 ALDH1B1P30837 517 aa21.89■■□□□ 1.09
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SH3BP4-210ENST00000489601 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-210ENST00000489601 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-210ENST00000489601 SCN4AP35499 1836 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-210ENST00000489601 ERBB4Q15303 1308 aa21.86■■□□□ 1.09
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SH3BP4-210ENST00000489601 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-210ENST00000489601 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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SH3BP4-210ENST00000489601 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-210ENST00000489601 ABCC12Q96J65 1359 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-210ENST00000489601 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-210ENST00000489601 RIPK4P57078 832 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-210ENST00000489601 CHADLQ6NUI6 762 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-210ENST00000489601 OLFM4Q6UX06 510 aa21.83■■□□□ 1.09
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SH3BP4-210ENST00000489601 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.82■■□□□ 1.08
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SH3BP4-210ENST00000489601 SUSD4Q5VX71 490 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 SYNE4Q8N205 404 aa21.81■■□□□ 1.08
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SH3BP4-210ENST00000489601 POTEJP0CG39 1038 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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SH3BP4-210ENST00000489601 PDIA6Q15084 440 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 PSMD1Q99460 953 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 FZD9O00144 591 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4-210ENST00000489601 NTSR2O95665 410 aa21.78■■□□□ 1.08
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