RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488989.1

CLDN11-208, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 4

Gene CLDN11, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN11-208ENST00000488989 PHF14O94880 888 aa20.14■□□□□ 0.81
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CLDN11-208ENST00000488989 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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