RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 TEFQ10587 303 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 LRRCC1Q9C099 1032 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 PALD1Q9ULE6 856 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 SURF6O75683 361 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM5Q9C035 493 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC112Q8NEF3 446 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP12Q02952 1782 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 TNNT1P13805 278 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 LRMPQ12912 555 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC186Q7Z3E2 898 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-204ENST00000483092 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 CKAP2LQ8IYA6 745 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 GNAI3P08754 354 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 MX1P20591 662 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 UVSSAQ2YD98 709 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 UNC5CLQ8IV45 518 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K5Q99683 1374 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 SMC3Q9UQE7 1217 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 FERMT3Q86UX7 667 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 USP44Q9H0E7 712 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM51Q9NW97 253 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 OGFRQ9NZT2 677 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 SSH2Q76I76 1423 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 SRGAP3O43295 1099 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1524Q8TCG1 905 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 DIP2AQ14689 1571 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 BTBD11A6QL63 1104 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 FBXW7Q969H0 707 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 MCM2P49736 904 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC66A2RUB6 948 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 LUZP1Q86V48 1076 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 TAF3Q5VWG9 929 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 KDRP35968 1356 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 ATP8B2P98198 1209 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC192P0DO97 292 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 KCNF1Q9H3M0 494 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 KIF24Q5T7B8 1368 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 FEZ1Q99689 392 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 NRBP1Q9UHY1 535 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-204ENST00000483092 CPA1P15085 419 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 CERS3Q8IU89 383 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 IP6K1Q92551 441 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2HP62256 183 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB9Q96C00 473 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 SLC39A6Q13433 755 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 PROSER3Q2NL68 480 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 FAM173BQ6P4H8 233 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 GCP02774 474 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC83Q8IWF9 413 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 SPTLC3Q9NUV7 552 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 NRKQ7Z2Y5 1582 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 AP5Z1O43299 807 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 STX6O43752 255 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 TIGD1Q96MW7 591 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 IL25Q9H293 177 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 MYL6BP14649 208 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 ST7Q9NRC1 585 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 TPM3P06753 285 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 GORABQ5T7V8 394 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 KRT222Q8N1A0 295 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 SYT1P21579 422 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 CABLES1Q8TDN4 633 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 AXIN2Q9Y2T1 843 aa19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.7 ms