RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 SUSD4Q5VX71 490 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 OLFM4Q6UX06 510 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 C3orf67Q6ZVT6 689 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 COPS6Q7L5N1 327 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 WWC1Q8IX03 1113 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 SYNE4Q8N205 404 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZBTB3Q9H5J0 574 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.22□□□□□ -1.57
UBE2Q1-204ENST00000476612 NFKBIEO00221 500 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 RGL2O15211 777 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ANP32CO43423 234 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 SRGNP10124 158 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 GPTP24298 496 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 RASSF7Q02833 373 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 LMOD3Q0VAK6 560 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 DUSP27Q5VZP5 1158 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 NUTM1Q86Y26 1132 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 TTLL6Q8N841 843 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF428Q96B54 188 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 MRS2Q9HD23 443 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.21□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIF13BQ9NQT8 1826 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 KDM3BQ7LBC6 1761 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 H0YIN7 160 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 NTSR2O95665 410 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 PDE6BP35913 854 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC27Q2M243 656 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ERFEQ4G0M1 354 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 CNBD1Q8NA66 436 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 IFT57Q9NWB7 429 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ATP10DQ9P241 1426 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ERBB4Q15303 1308 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ABCC12Q96J65 1359 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 POTECB2RU33 542 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIF3CO14782 793 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 C21orf2O43822 256 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 GNAI1P63096 354 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 TCIRG1Q13488 830 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 CRY2Q49AN0 593 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC10A5Q5PT55 438 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 STYK1Q6J9G0 422 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 G2E3Q7L622 706 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 NLRP10Q86W26 655 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 MASTLQ96GX5 879 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ISCA1Q9BUE6 129 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.19□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 HOXB7P09629 217 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 NPR1P16066 1061 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 C1QTNF8P60827 252 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 RNF181Q9P0P0 153 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF521Q96K83 1311 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 SCN7AQ01118 1682 aa5.18□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa5.17□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 SNED1Q8TER0 1413 aa5.17□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 VAMP4O75379 141 aa5.17□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 ST5P78524 1137 aa5.17□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIF6Q6ZMV9 814 aa5.17□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 WDR63Q8IWG1 891 aa5.17□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 CNKSR1Q969H4 720 aa5.17□□□□□ -1.58
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM89AQ96GI7 184 aa5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms