RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476510.5

GTPBP2-208, Transcript of GTP binding protein 2, human

TSL 5

Gene GTPBP2, Length 2,816 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP2-208	ENST00000476510	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	GRM8	O00222	908 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	ABCC6	O95255	1503 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510		A0A087WZG4	1122 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	MCM4	P33991	863 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	USP21	Q9UK80	565 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	GCKR	Q14397	625 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	GPT	P24298	496 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP2-208	ENST00000476510	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	C5	P01031	1676 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	TRAK2	O60296	914 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	STARD3NL	O95772	234 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	DISP2	A7MBM2	1401 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	SDS	P20132	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	MRC1	P22897	1456 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	PDE1A	P54750	535 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	HLF	Q16534	295 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	MX1	P20591	662 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	POLA2	Q14181	598 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	BCL9	O00512	1426 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.52	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.52	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
GTPBP2-208	ENST00000476510	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	AFF2	P51816	1311 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	SIK1	P57059	783 aa		13.51	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms