RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471664.1

GLIS3-210, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 1,569 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-210ENST00000471664 LDHDQ86WU2 507 aa15.93■□□□□ 0.14
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GLIS3-210ENST00000471664 NGEFQ8N5V2 710 aa15.76■□□□□ 0.11
GLIS3-210ENST00000471664 CFAP53Q96M91 514 aa15.76■□□□□ 0.11
GLIS3-210ENST00000471664 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.76■□□□□ 0.11
GLIS3-210ENST00000471664 EPS15P42566 896 aa15.75■□□□□ 0.11
GLIS3-210ENST00000471664 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
GLIS3-210ENST00000471664 NYXQ9GZU5 481 aa15.75■□□□□ 0.11
GLIS3-210ENST00000471664 NUDCQ9Y266 331 aa15.75■□□□□ 0.11
GLIS3-210ENST00000471664 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
GLIS3-210ENST00000471664 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
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