RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 LINS1Q8NG48 757 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 RBSNQ9H1K0 784 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 SYCE3A1L190 88 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 GRM8O00222 908 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 RASEFQ8IZ41 740 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE4-204ENST00000465425 AK2P54819 239 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 AACSQ86V21 672 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 TTC14Q96N46 770 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 ERBB3P21860 1342 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 EVI5LQ96CN4 794 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 SUCLG2Q96I99 432 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF790Q6PG37 636 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.04■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.04■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 UTYO14607 1347 aa22.04■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 RUFY3Q7L099 469 aa22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 HIP1O00291 1037 aa22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 PTH1RQ03431 593 aa22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 SLC39A6Q13433 755 aa22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 PHF14O94880 888 aa22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 MYL6BP14649 208 aa22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 PDIA6Q15084 440 aa22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-204ENST00000465425 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 USP48Q86UV5 1035 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 KAZALD1Q96I82 304 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 SASH1O94885 1247 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 CPA1P15085 419 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 KCNJ4P48050 445 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 NPHP3Q7Z494 1330 aa22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 STX6O43752 255 aa22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 TATP17735 454 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 HS1BP3Q53T59 392 aa22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 VPS53Q5VIR6 699 aa22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 SIL1Q9H173 461 aa22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV5-2P06315 115 aa22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 PDLIM2Q96JY6 352 aa22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 C19orf44Q9H6X5 657 aa22■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 SYT1P21579 422 aa21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 TSPY26PQ9H489 355 aa21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 KIF1AQ12756 1690 aa21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 PHKG2P15735 406 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 NECTIN1Q15223 517 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 COPS6Q7L5N1 327 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 RNF214Q8ND24 703 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 GCKRQ14397 625 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.96■■□□□ 1.11
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