RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 POTEJP0CG39 1038 aa15.56■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 MASTLQ96GX5 879 aa15.56■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.56■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.54■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 CFAP53Q96M91 514 aa15.54■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 BTBD11A6QL63 1104 aa15.53■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 RGL2O15211 777 aa15.53■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 SRGNP10124 158 aa15.53■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.53■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 SLX4Q8IY92 1834 aa15.52■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 CAMTA2O94983 1202 aa15.52■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 CCDC93Q567U6 631 aa15.52■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 LDHDQ86WU2 507 aa15.52■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 IL17REQ8NFR9 667 aa15.52■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 CACNA1SQ13698 1873 aa15.52■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 SCN4AP35499 1836 aa15.52■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 BCORQ6W2J9 1755 aa15.52■□□□□ 0.07
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PRAME-210ENST00000442481 FOXN1O15353 648 aa15.51■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 NPR1P16066 1061 aa15.51■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 PPP2R1AP30153 589 aa15.51■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
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PRAME-210ENST00000442481 NUDCQ9Y266 331 aa15.51■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 CNTNAP1P78357 1384 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 A1BGP04217 495 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.5■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 PASKQ96RG2 1323 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.49■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 ALDH1B1P30837 517 aa15.48■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 HACL1Q9UJ83 578 aa15.47■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.46■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 KCNQ3O43525 872 aa15.46■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 PRKAR2BP31323 418 aa15.46■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.46■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.46■□□□□ 0.07
PRAME-210ENST00000442481 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 NEFMP07197 916 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
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PRAME-210ENST00000442481 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.45■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.45■□□□□ 0.06
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PRAME-210ENST00000442481 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.44■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 OLFM4Q6UX06 510 aa15.44■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 JDP2Q8WYK2 163 aa15.44■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 NYXQ9GZU5 481 aa15.44■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.44■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 USP16Q9Y5T5 823 aa15.44■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.43■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 EPHX2P34913 555 aa15.43■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.062e-24■□□□□ 8.6
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PRAME-210ENST00000442481 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 GPC2Q8N158 579 aa15.42■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 PHACTR3Q96KR7 559 aa15.42■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 RALBP1Q15311 655 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 PSMD1Q99460 953 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 WBP1LQ9NX94 342 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 FZD9O00144 591 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 LBX1P52954 281 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 EIF6P56537 245 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PRAME-210ENST00000442481 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 MCM10Q7L590 875 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 SYNE4Q8N205 404 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 RASSF10A6NK89 507 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PRAME-210ENST00000442481 CNTROBQ8N137 903 aa15.38■□□□□ 0.05
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