RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
ELL3-202ENST00000433927 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
ELL3-202ENST00000433927 RGL2O15211 777 aa26.9■■□□□ 1.9
ELL3-202ENST00000433927 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
ELL3-202ENST00000433927 MASTLQ96GX5 879 aa26.9■■□□□ 1.9
ELL3-202ENST00000433927 SRGNP10124 158 aa26.89■■□□□ 1.9
ELL3-202ENST00000433927 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
ELL3-202ENST00000433927 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.89■■□□□ 1.9
ELL3-202ENST00000433927 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
ELL3-202ENST00000433927 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.89■■□□□ 1.9
ELL3-202ENST00000433927 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.88■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 NBPF26B4DH59 902 aa26.88■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 SOGA3Q5TF21 947 aa26.88■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.88■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 NBPF15Q8N660 670 aa26.88■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.88■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.88■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.88■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 WDR90Q96KV7 1748 aa26.87■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.87■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.86■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 ERFEQ4G0M1 354 aa26.85■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 IFFO2Q5TF58 517 aa26.85■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.85■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 SLX4Q8IY92 1834 aa26.85■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.85■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 CACNA1SQ13698 1873 aa26.85■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 NFE2L2Q16236 605 aa26.84■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.84■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.84■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.83■■□□□ 1.89
ELL3-202ENST00000433927 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.81■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 NPR1P16066 1061 aa26.81■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 HLFQ16534 295 aa26.79■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 KLRG1Q96E93 195 aa26.79■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 FAM177BA6PVY3 158 aa26.78■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 HTRA3P83110 453 aa26.78■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 NGEFQ8N5V2 710 aa26.78■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.77■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 CCDC93Q567U6 631 aa26.77■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
ELL3-202ENST00000433927 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.76■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.76■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 NYXQ9GZU5 481 aa26.76■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 POTECB2RU33 542 aa26.75■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 RALBP1Q15311 655 aa26.75■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.74■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 ALDH1B1P30837 517 aa26.74■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 NUP98P52948 1817 aa26.74■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 MYL6BP14649 208 aa26.72■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.72■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 ERBB4Q15303 1308 aa26.71■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 JMYQ8N9B5 988 aa26.71■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.71■■□□□ 1.87
ELL3-202ENST00000433927 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 RIPK4P57078 832 aa26.7■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.7■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.68■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.68■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.68■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.68■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.67■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 GPTP24298 496 aa26.66■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 CRY2Q49AN0 593 aa26.66■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 CHADLQ6NUI6 762 aa26.65■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 OLFM4Q6UX06 510 aa26.65■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 ABCC12Q96J65 1359 aa26.65■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
ELL3-202ENST00000433927 SCN4AP35499 1836 aa26.63■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 SUSD4Q5VX71 490 aa26.63■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.63■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.63■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.63■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 SYNE4Q8N205 404 aa26.63■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.63■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.62■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 PARP10Q53GL7 1025 aa26.61■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 PSMD1Q99460 953 aa26.61■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.6■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 NTSR2O95665 410 aa26.59■■□□□ 1.85
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