RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.37□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STARD3NLO95772 234 aa12.37□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PROSER3Q2NL68 480 aa12.37□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BRWD3Q6RI45 1802 aa12.37□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KAT6BQ8WYB5 2073 aa12.37□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MEIS3Q99687 375 aa12.37□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDE4AP27815 886 aa12.36□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCT4P50991 539 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMC5Q8IY18 1101 aa12.36□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.36□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.35□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP10DQ9P241 1426 aa12.35□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PALLDQ8WX93 1383 aa12.35□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDX58O95786 925 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SBF2Q86WG5 1849 aa12.35□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.34□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDIA6Q15084 440 aa12.34□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BACH2Q9BYV9 841 aa12.34□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BTAF1O14981 1849 aa12.34□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNQ2O43526 872 aa12.33□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADCY9O60503 1353 aa12.33□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SIK1P57059 783 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CEP85Q6P2H3 762 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD44Q8N8A2 993 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP16Q9Y5T5 823 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PI4KAP2A4QPH2 592 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP6V1AP38606 617 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM182BQ5T319 152 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TJP1Q07157 1748 aa12.31□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYL6BP14649 208 aa12.31□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUCB1Q02818 461 aa12.31□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POTEAQ6S8J7 498 aa12.31□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAJC10Q8IXB1 793 aa12.31□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAAF4Q8WXU2 420 aa12.31□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C8orf34Q49A92 452 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BEND3Q5T5X7 828 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CREBZFQ9NS37 354 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LY75O60449 1722 aa12.29□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM161AQ3B820 660 aa12.29□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GCC1Q96CN9 775 aa12.29□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa12.29□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP44Q9H0E7 712 aa12.29□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GNAI2P04899 355 aa12.28□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.28□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD45Q5TZF3 282 aa12.28□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KSR2Q6VAB6 950 aa12.28□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRP10Q7Z4F1 713 aa12.28□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHD1LQ86WJ1 897 aa12.28□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LNPKQ9C0E8 428 aa12.28□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DCTPP1Q9H773 170 aa12.28□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa12.28□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRIM37O94972 964 aa12.27□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GNAI3P08754 354 aa12.27□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF6Q6ZMV9 814 aa12.27□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COPS6Q7L5N1 327 aa12.27□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.27□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 XAGE3Q8WTP9 111 aa12.27□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.27□□□□□ -0.44
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A1BGP04217 495 aa12.27□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.27□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.27□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLBD2Q8NHP8 589 aa12.27□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.27□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HDAC5Q9UQL6 1122 aa12.27□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RREB1Q92766 1687 aa12.26□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBPF26B4DH59 902 aa12.26□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRKLP46109 303 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP8B2P98198 1209 aa12.26□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBPF14Q5TI25 921 aa12.26□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBPF15Q8N660 670 aa12.26□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.25□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A087WZG4 1122 aa12.25□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa12.25□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ALDH1L1O75891 902 aa12.25□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ITPK1Q13572 414 aa12.24□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa12.24□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms