RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 NLRP8Q86W28 1048 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 C1orf216Q8TAB5 229 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 ARXQ96QS3 562 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 ATAD2Q6PL18 1390 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 SHISA8B8ZZ34 492 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 FIGNL1Q6PIW4 674 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 C7orf43Q8WVR3 580 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 GGA1Q9UJY5 639 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 NEURL1BA8MQ27 555 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 OIP5O43482 229 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 IRS1P35568 1242 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 MAP2K3P46734 347 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 GSK3AP49840 483 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 NEDD1Q8NHV4 660 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 STK32AQ8WU08 396 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 ARID3AQ99856 593 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 NEUROD4Q9HD90 331 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 CHMP3Q9Y3E7 222 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 FAM157BP0CG42 384 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 GALNT6Q8NCL4 622 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 FAM200AQ8TCP9 573 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 PRIMPOLQ96LW4 560 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 KLF15Q9UIH9 416 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-208ENST00000427110 EFSO43281 561 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 PRMT3O60678 531 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 POTEAQ6S8J7 498 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 SUSD3Q96L08 255 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 CEP63Q96MT8 703 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 SLC30A3Q99726 388 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 RRAGCQ9HB90 399 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 MARK1Q9P0L2 795 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 IGFBP4P22692 258 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 AMPD1P23109 780 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 RASSF7Q02833 373 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 SAMD5Q5TGI4 173 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 C1orf53Q5VUE5 145 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC82Q8N4S0 544 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 C1orf115Q9H7X2 142 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 ENAMQ9NRM1 1142 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 KLK14Q9P0G3 267 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 GDF11O95390 407 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 ARAFP10398 606 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 EPXP11678 715 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 WEE1P30291 646 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 TYRO3Q06418 890 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 KCNMA1Q12791 1236 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 BRD7Q9NPI1 651 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 BCS1LQ9Y276 419 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 ADH6P28332 368 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 DGKZQ13574 1117 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 FAM182BQ5T319 152 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM164Q5U3C3 297 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 CAPN12Q6ZSI9 719 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 BTLAQ7Z6A9 289 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 SYT9Q86SS6 491 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 STAG2Q8N3U4 1231 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 SPEM2Q0P670 501 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 RTN1Q16799 776 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 PODNQ7Z5L7 613 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 VTI1AQ96AJ9 217 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 BTBD6Q96KE9 485 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 USP20Q9Y2K6 914 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 ATG7O95352 703 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-208ENST00000427110 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.66□□□□□ -1.66
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