RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 SOGA3Q5TF21 947 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 KIF1BO60333 1816 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 TESK2Q96S53 571 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 POTEJP0CG39 1038 aa8.31□□□□□ -1.08
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ALMS1-201ENST00000423048 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 VPS36Q86VN1 386 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 BTBD11A6QL63 1104 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 A0A0G2JS52 829 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 WASHC4Q2M389 1173 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 EPS15P42566 896 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 SEMA3FQ13275 785 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 BRAPQ7Z569 592 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 TSG101Q99816 390 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 KRT23Q9C075 422 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 NCAPD2Q15021 1401 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 SLC5A1P13866 664 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 ATP8B2P98198 1209 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 MAP3K12Q12852 859 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 IFNL2Q8IZJ0 200 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 FBXO41Q8TF61 875 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 DCTPP1Q9H773 170 aa8.3□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 RTL9Q8NET4 1388 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 APPP05067 770 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 TRIM14Q14142 442 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 KIF18AQ8NI77 898 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 TNIP1Q15025 636 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 MAP3K5Q99683 1374 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.29□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CLCN1P35523 988 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.089e-7■□□□□ 10.1
ALMS1-201ENST00000423048 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 SRGAP3O43295 1099 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 OFD1O75665 1012 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 UBAC1Q9BSL1 405 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 USP37Q86T82 979 aa8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 DLC1Q96QB1 1528 aa8.27□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 SYCP1Q15431 976 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 PLCG2P16885 1265 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 VPS53Q5VIR6 699 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 AACSQ86V21 672 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.094e-7■■□□□ 14
ALMS1-201ENST00000423048 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.27□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 HMOX1P09601 288 aa8.26□□□□□ -1.09
ALMS1-201ENST00000423048 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
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