RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EID1Q9Y6B2 187 aa6.86□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP31Q70CQ4 1352 aa6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF853P0CG23 659 aa6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IL13P35225 146 aa6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NFE2L2Q16236 605 aa6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COG3Q96JB2 828 aa6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IFT57Q9NWB7 429 aa6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.85□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SSH2Q76I76 1423 aa6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OATP04181 439 aa6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RIPK4P57078 832 aa6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GNAI1P63096 354 aa6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.84□□□□□ -1.31
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FECHP22830 423 aa6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FUT2Q10981 343 aa6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP2K5Q13163 448 aa6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C8orf34Q49A92 452 aa6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIFC2Q96AC6 838 aa6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSPOAP1O95153 1857 aa6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.83□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C3P01024 1663 aa6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM32Q13049 653 aa6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP6P35125 1406 aa6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTPRUQ92729 1446 aa6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIAA0232Q92628 1395 aa6.82□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZMYND10O75800 440 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGHDP01880 384 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VEGFBP49765 207 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMC5Q8IY18 1101 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COG6Q9Y2V7 657 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AKAP12Q02952 1782 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARHGEF10O15013 1369 aa6.81□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERBB4Q15303 1308 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IRF6O14896 467 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RLBP1P12271 317 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM27P14373 513 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LTKP29376 864 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRKAR2BP31323 418 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NEUROD2Q15784 382 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BARGINQ6ZT62 677 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PANK1Q8TE04 598 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IRF7Q92985 503 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KDRP35968 1356 aa6.8□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VAMP4O75379 141 aa6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MLECQ14165 292 aa6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GCC1Q96CN9 775 aa6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RTL1A6NKG5 1358 aa6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.79□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ABCC4O15439 1325 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ACEP12821 1306 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP54Q70EL1 1684 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms