RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.7■■□□□ 1.86
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SH3BP5-204ENST00000412806 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5-204ENST00000412806 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SH3BP5-204ENST00000412806 GCKRQ14397 625 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP5-204ENST00000412806 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP5-204ENST00000412806 KAZALD1Q96I82 304 aa26.69■■□□□ 1.86
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SH3BP5-204ENST00000412806 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.67■■□□□ 1.86
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SH3BP5-204ENST00000412806 SLC4A3P48751 1232 aa26.63■■□□□ 1.85
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SH3BP5-204ENST00000412806 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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SH3BP5-204ENST00000412806 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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SH3BP5-204ENST00000412806 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.58■■□□□ 1.85
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SH3BP5-204ENST00000412806 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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SH3BP5-204ENST00000412806 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
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SH3BP5-204ENST00000412806 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.52■■□□□ 1.84
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SH3BP5-204ENST00000412806 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP5-204ENST00000412806 CASC1Q6TDU7 716 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.5■■□□□ 1.83
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SH3BP5-204ENST00000412806 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
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SH3BP5-204ENST00000412806 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SH3BP5-204ENST00000412806 SASH1O94885 1247 aa26.49■■□□□ 1.83
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SH3BP5-204ENST00000412806 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP5-204ENST00000412806 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP5-204ENST00000412806 NUP98P52948 1817 aa26.49■■□□□ 1.83
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.47■■□□□ 1.83
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SH3BP5-204ENST00000412806 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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SH3BP5-204ENST00000412806 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SH3BP5-204ENST00000412806 RILPL2Q969X0 211 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP5-204ENST00000412806 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP5-204ENST00000412806 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.46■■□□□ 1.83
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SH3BP5-204ENST00000412806 COPRSQ9NQ92 184 aa26.45■■□□□ 1.83
SH3BP5-204ENST00000412806 RREB1Q92766 1687 aa26.45■■□□□ 1.82
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