RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
ODC1-202ENST00000405333 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.33■■□□□ 1.65
ODC1-202ENST00000405333 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
ODC1-202ENST00000405333 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 LINS1Q8NG48 757 aa25.31■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.3■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 CEP85Q6P2H3 762 aa25.3■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.3■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.3■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 ARXQ96QS3 562 aa25.3■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.29■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.29■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 TRIM37O94972 964 aa25.29■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 GNAI2P04899 355 aa25.29■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 GNAI3P08754 354 aa25.29■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.29■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 ALDH1L1O75891 902 aa25.28■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 LY75O60449 1722 aa25.28■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 RREB1Q92766 1687 aa25.28■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.27■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.27■■□□□ 1.64
ODC1-202ENST00000405333 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 GCKRQ14397 625 aa25.25■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.25■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 SMIM5Q71RC9 77 aa25.24■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 GRM8O00222 908 aa25.24■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 HLFQ16534 295 aa25.24■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.24■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 SMC5Q8IY18 1101 aa25.23■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.22■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.22■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.22■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.22■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ODC1-202ENST00000405333 KAZALD1Q96I82 304 aa25.2■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.2■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 UTYO14607 1347 aa25.2■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 NUP98P52948 1817 aa25.2■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 RGS3P49796 1198 aa25.2■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 SUCLG2Q96I99 432 aa25.19■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 ATP8B2P98198 1209 aa25.18■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 TCIRG1Q13488 830 aa25.18■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.18■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.18■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 A0A087WZG4 1122 aa25.17■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.17■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 COL15A1P39059 1388 aa25.16■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.16■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.16■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 GPTP24298 496 aa25.16■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 DCTPP1Q9H773 170 aa25.16■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.15■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.15■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 CASP7P55210 303 aa25.14■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 GCC1Q96CN9 775 aa25.14■■□□□ 1.62
ODC1-202ENST00000405333 C4BP0C0L5 1744 aa25.14■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 NUCB1Q02818 461 aa25.14■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.14■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 APBB1O00213 710 aa25.13■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 GNPATO15228 680 aa25.13■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 SRGAP3O43295 1099 aa25.13■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 HMMRO75330 724 aa25.13■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 CAMTA2O94983 1202 aa25.13■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.13■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 LNPKQ9C0E8 428 aa25.13■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.12■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 PDE4AP27815 886 aa25.12■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 BCL11AQ9H165 835 aa25.12■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.12■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 PROM2Q8N271 834 aa25.12■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 SSH3Q8TE77 659 aa25.12■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 H7C1W4 665 aa25.11■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 POLA2Q14181 598 aa25.1■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.1■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.1■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 SYNE4Q8N205 404 aa25.1■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 BCORQ6W2J9 1755 aa25.09■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 RPS6KA4O75676 772 aa25.09■■□□□ 1.61
ODC1-202ENST00000405333 APBA3O96018 575 aa25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms