RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 NPHP1O15259 732 aa26.18■■□□□ 1.78
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HOXD12-201ENST00000404162 A1BGP04217 495 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 SOGA3Q5TF21 947 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 ST5P78524 1137 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF790Q6PG37 636 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 SLC34A2O95436 690 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 IL17REQ8NFR9 667 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.15■■□□□ 1.78
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HOXD12-201ENST00000404162 TEFQ10587 303 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.13■■□□□ 1.77
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HOXD12-201ENST00000404162 CCDC93Q567U6 631 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 HACL1Q9UJ83 578 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 BCORQ6W2J9 1755 aa26.12■■□□□ 1.77
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HOXD12-201ENST00000404162 ABHD8Q96I13 439 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 RASSF10A6NK89 507 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 EPHX2P34913 555 aa26.11■■□□□ 1.77
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HOXD12-201ENST00000404162 KCNQ3O43525 872 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 FAM161AQ3B820 660 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 NPR1P16066 1061 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD12-201ENST00000404162 USP16Q9Y5T5 823 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD12-201ENST00000404162 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD12-201ENST00000404162 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD12-201ENST00000404162 FZD9O00144 591 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD12-201ENST00000404162 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD12-201ENST00000404162 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD12-201ENST00000404162 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
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HOXD12-201ENST00000404162 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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HOXD12-201ENST00000404162 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD12-201ENST00000404162 SYNE4Q8N205 404 aa26.03■■□□□ 1.76
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HOXD12-201ENST00000404162 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
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HOXD12-201ENST00000404162 FAM177BA6PVY3 158 aa26■■□□□ 1.75
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HOXD12-201ENST00000404162 TPTE2Q6XPS3 522 aa26■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 GPC2Q8N158 579 aa26■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 LTBP1Q14766 1721 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 SNED1Q8TER0 1413 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 ALDH1B1P30837 517 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXD12-201ENST00000404162 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.95■■□□□ 1.74
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HOXD12-201ENST00000404162 CAPNS2Q96L46 248 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 COL4A5P29400 1685 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 NBPF26B4DH59 902 aa25.94■■□□□ 1.74
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HOXD12-201ENST00000404162 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 NBPF15Q8N660 670 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 JDP2Q8WYK2 163 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 PSMD1Q99460 953 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 RGS19P49795 217 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 HLFQ16534 295 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 EPS15P42566 896 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 ECE1P42892 770 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 SCNN1DP51172 638 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 CST9Q5W186 159 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.91■■□□□ 1.74
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