RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 ZEB2O60315 1214 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 RLBP1P12271 317 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 KARSQ15046 597 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CABP1Q9NZU7 370 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CERS3Q8IU89 383 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 ABCC11Q96J66 1382 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 WASF1Q92558 559 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 UBE4AQ14139 1066 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CCDC114Q96M63 670 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 PRAM1Q96QH2 718 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 MYZAPP0CAP1 466 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 KDM2BQ8NHM5 1336 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 OPA1O60313 960 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 PPP2R3AQ06190 1150 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 MCM10Q7L590 875 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 HDXQ7Z353 690 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 MAPKBP1O60336 1514 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CTAGE9A4FU28 777 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 NLRP6P59044 892 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 PPM1EQ8WY54 764 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 SYNJ1O43426 1573 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CCDC57Q2TAC2 916 aa11.27□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.27□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.27□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 IFNKQ9P0W0 207 aa11.27□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 DAPK1P53355 1430 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 PRXQ9BXM0 1461 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GUA9 196 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CCDC102BQ68D86 513 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 FAM76AQ8TAV0 307 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 UBAC1Q9BSL1 405 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 N4BP3O15049 544 aa11.26□□□□□ -0.61
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HERC3-202ENST00000402738 GOLGA8BA8MQT2 603 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 ANAPC15P60006 121 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 ZSCAN26Q16670 478 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 PIP4K2BP78356 416 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 SYKP43405 635 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CARD6Q9BX69 1037 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 MAP2K2P36507 400 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 PTPRGP23470 1445 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 PDE1AP54750 535 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 ZNF569Q5MCW4 686 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 BANK1Q8NDB2 785 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 NEK11Q8NG66 645 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CDK19Q9BWU1 502 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 AFAP1L1Q8TED9 768 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 FSD2A1L4K1 749 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 MYL6BP14649 208 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 INPP5BP32019 993 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
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