RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.61■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 MYD88Q99836 296 aa22.6■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.6■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.59■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 IGKV5-2P06315 115 aa22.59■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.59■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.59■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.59■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 HLFQ16534 295 aa22.59■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.58■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.58■■□□□ 1.21
UBXN6-202ENST00000394765 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 GNPATO15228 680 aa22.57■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.57■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 PLSCR1O15162 318 aa22.57■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 RREB1Q92766 1687 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 USP44Q9H0E7 712 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 COL15A1P39059 1388 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 ATP10DQ9P241 1426 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 PHF14O94880 888 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 C4BP0C0L5 1744 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 LINS1Q8NG48 757 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.52■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 RPS6KA4O75676 772 aa22.52■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 IGHDP01880 384 aa22.52■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 AK7Q96M32 723 aa22.52■■□□□ 1.2
UBXN6-202ENST00000394765 CAMTA2O94983 1202 aa22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF827Q17R98 1081 aa22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 GPTP24298 496 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 TCIRG1Q13488 830 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 GCKRQ14397 625 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 ALDH1L1O75891 902 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 GRM8O00222 908 aa22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-202ENST00000394765 A0A087WZG4 1122 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 SYNE4Q8N205 404 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 KAZALD1Q96I82 304 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 GNAI2P04899 355 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 GNAI3P08754 354 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 CEP85Q6P2H3 762 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 SKAP1Q86WV1 359 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 AKT1S1Q96B36 256 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 SUCLG2Q96I99 432 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 FAM177BA6PVY3 158 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 AAMPQ13685 434 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 NARFQ9UHQ1 456 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 NLRP10Q86W26 655 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 UTYO14607 1347 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 CASP7P55210 303 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 RFC4P35249 363 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 BAG6P46379 1132 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms