RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 MCCP23508 829 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 PALD1Q9ULE6 856 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 COPS6Q7L5N1 327 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 TMX3Q96JJ7 454 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DCAF5Q96JK2 942 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CPDO75976 1380 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ESPNB1AK53 854 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTS2O95450 1211 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0G2JS52 829 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CUL4AQ13619 759 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 KSR2Q6VAB6 950 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.77■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF445P59923 1031 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 PIP4K2BP78356 416 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 IL2RBP14784 551 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 MYD88Q99836 296 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 IL25Q9H293 177 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 ERBB4Q15303 1308 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 A1BGP04217 495 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV5-2P06315 115 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 SIL1Q9H173 461 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 HYPKQ9NX55 129 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 SUCLG2Q96I99 432 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 HSPA4P34932 840 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 GPT2Q8TD30 523 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 BRD1O95696 1058 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 KAZALD1Q96I82 304 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 MTX1Q13505 466 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 SGSM2O43147 1006 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 NBPF26B4DH59 902 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 NBPF14Q5TI25 921 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 NBPF15Q8N660 670 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 GRM8O00222 908 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 RAD50Q92878 1312 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 CNTROBQ8N137 903 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 LINS1Q8NG48 757 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 ALDH1L1O75891 902 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 C5P01031 1676 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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