RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336070.11

FRMD1-202, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FRMD1, Length 1,600 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-202ENST00000336070 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.03■■□□□ 1.28
FRMD1-202ENST00000336070 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.03■■□□□ 1.28
FRMD1-202ENST00000336070 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.03■■□□□ 1.28
FRMD1-202ENST00000336070 TJP1Q07157 1748 aa23.02■■□□□ 1.28
FRMD1-202ENST00000336070 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.02■■□□□ 1.28
FRMD1-202ENST00000336070 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.01■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.01■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 A0A087WZG4 1122 aa23■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 USP44Q9H0E7 712 aa23■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.99■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.99■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 RGL2O15211 777 aa22.98■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 RPS6KA4O75676 772 aa22.98■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 APBA3O96018 575 aa22.98■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 MEIS3Q99687 375 aa22.98■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 MYD88Q99836 296 aa22.97■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.97■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 GNAI2P04899 355 aa22.97■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 IGKV5-2P06315 115 aa22.97■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 TCIRG1Q13488 830 aa22.97■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 LY75O60449 1722 aa22.97■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 TXNRD1Q16881 649 aa22.96■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.96■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.96■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FRMD1-202ENST00000336070 UTYO14607 1347 aa22.95■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 KCNQ4P56696 695 aa22.95■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 GCKRQ14397 625 aa22.95■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 ARXQ96QS3 562 aa22.95■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.95■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 RREB1Q92766 1687 aa22.95■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 EP400Q96L91 3159 aa22.94■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 GRM8O00222 908 aa22.93■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.93■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.93■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 PROM2Q8N271 834 aa22.93■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.93■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 COL15A1P39059 1388 aa22.93■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 ADRA2BP18089 450 aa22.92■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.91■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 AK7Q96M32 723 aa22.91■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 GNPATO15228 680 aa22.9■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.9■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.9■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.9■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 CAMTA2O94983 1202 aa22.9■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 IGHDP01880 384 aa22.9■■□□□ 1.26
FRMD1-202ENST00000336070 HMMRO75330 724 aa22.89■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 CEP85Q6P2H3 762 aa22.89■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.89■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 HLFQ16534 295 aa22.88■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.88■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 CCDC125Q86Z20 511 aa22.88■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 NARFQ9UHQ1 456 aa22.88■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 H7C1W4 665 aa22.87■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.87■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 SSFA2P28290 1259 aa22.86■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 ATP8B2P98198 1209 aa22.86■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.86■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.86■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 ZPR1O75312 459 aa22.85■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 MTX1Q13505 466 aa22.85■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 PARP10Q53GL7 1025 aa22.85■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 GCC1Q96CN9 775 aa22.85■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 C4BP0C0L5 1744 aa22.84■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 NLRP10Q86W26 655 aa22.84■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.84■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 RFC4P35249 363 aa22.83■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 BAG6P46379 1132 aa22.83■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 CASP7P55210 303 aa22.83■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 SMC5Q8IY18 1101 aa22.83■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.83■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.83■■□□□ 1.25
FRMD1-202ENST00000336070 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
FRMD1-202ENST00000336070 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.82■■□□□ 1.24
FRMD1-202ENST00000336070 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.82■■□□□ 1.24
FRMD1-202ENST00000336070 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FRMD1-202ENST00000336070 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.81■■□□□ 1.24
FRMD1-202ENST00000336070 SSH3Q8TE77 659 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms