RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.27■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 MCM2P49736 904 aa25.27■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.27■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 CNTROBQ8N137 903 aa25.27■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 RAD50Q92878 1312 aa25.27■■□□□ 1.64
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPA4P34932 840 aa25.26■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 CUL4AQ13619 759 aa25.25■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.25■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.25■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.25■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.24■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 DCAF5Q96JK2 942 aa25.24■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.23■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 ARXQ96QS3 562 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 MYL6BP14649 208 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
KCNQ1-202ENST00000335475 SASH1O94885 1247 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 MRE11P49959 708 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 PANK2Q9BZ23 570 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCA3Q99758 1704 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 COPS6Q7L5N1 327 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 USP16Q9Y5T5 823 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.19■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPA2P54652 639 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 GCKRQ14397 625 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 BRINP3Q76B58 766 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 PAPPAQ13219 1627 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 MCTP1Q6DN14 999 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 MYD88Q99836 296 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 AACSQ86V21 672 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 GPATCH3Q96I76 525 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 STRCQ7RTU9 1775 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.15■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 COL15A1P39059 1388 aa25.15■■□□□ 1.62
KCNQ1-202ENST00000335475 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.14■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.14■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 TTC14Q96N46 770 aa25.14■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 BRD1O95696 1058 aa25.13■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 RASEFQ8IZ41 740 aa25.13■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 CABP4P57796 275 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 EVI5LQ96CN4 794 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 TJP1Q07157 1748 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 PTH1RQ03431 593 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNB2Q92953 911 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 SIL1Q9H173 461 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 COPRSQ9NQ92 184 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ1-202ENST00000335475 CASP7P55210 303 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ1-202ENST00000335475 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.07■■□□□ 1.6
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