RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329565.5

SNN-201, Transcript of stannin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNN, Length 3,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNN-201ENST00000329565 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.07■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 TTC14Q96N46 770 aa22.07■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 ANXA1P04083 346 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 CCDC192P0DO97 292 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 PTH1RQ03431 593 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 GTF3C6Q969F1 213 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 FEZ1Q99689 392 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 USP27XA6NNY8 438 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 MTMR6Q9Y217 621 aa22.06■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 ACEP12821 1306 aa22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 LIG1P18858 919 aa22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 ELF2Q15723 593 aa22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.05■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 AMPHP49418 695 aa22.03■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 CNTROBQ8N137 903 aa22.03■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 FOSBP53539 338 aa22.03■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.03■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 GORABQ5T7V8 394 aa22.03■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 KIF18AQ8NI77 898 aa22.03■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 TERF2Q15554 542 aa22.03■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 HYPKQ9NX55 129 aa22.03■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 TTC6Q86TZ1 520 aa22.02■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 STK3Q13188 491 aa22.02■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.02■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 SSH2Q76I76 1423 aa22.02■■□□□ 1.12
SNN-201ENST00000329565 ME3Q16798 604 aa22.01■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 EYA1Q99502 592 aa22.01■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.01■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 TYRO3Q06418 890 aa22.01■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.01■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 CEP135Q66GS9 1140 aa22.01■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.01■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 DACT1Q9NYF0 836 aa22.01■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.01■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.01■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 KRT222Q8N1A0 295 aa22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 SMTNL1A8MU46 457 aa22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 PPFIA3O75145 1194 aa22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 TIGD1Q96MW7 591 aa22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 TNMDQ9H2S6 317 aa22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 CBX8Q9HC52 389 aa22■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.99■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 MAP3K11Q16584 847 aa21.99■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 SSH3Q8TE77 659 aa21.99■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.98■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.98■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.98■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 ST3GAL1Q11201 340 aa21.98■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.98■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.98■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 TMX1Q9H3N1 280 aa21.98■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.97■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.97■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 CCDC66A2RUB6 948 aa21.96■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 TAF3Q5VWG9 929 aa21.96■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.96■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 USP16Q9Y5T5 823 aa21.96■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 RAB11FIP3O75154 756 aa21.96■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 KRT85P78386 507 aa21.96■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 BICD2Q8TD16 824 aa21.96■■□□□ 1.11
SNN-201ENST00000329565 IL17REQ8NFR9 667 aa21.95■■□□□ 1.1
SNN-201ENST00000329565 FAM227BQ96M60 508 aa21.95■■□□□ 1.1
SNN-201ENST00000329565 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.94■■□□□ 1.1
SNN-201ENST00000329565 ZNF165P49910 485 aa21.94■■□□□ 1.1
SNN-201ENST00000329565 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.94■■□□□ 1.1
SNN-201ENST00000329565 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SNN-201ENST00000329565 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.94■■□□□ 1.1
SNN-201ENST00000329565 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.2 ms