RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 MYD88Q99836 296 aa27.98■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 GCKRQ14397 625 aa27.97■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.96■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 EVA1CP58658 441 aa27.96■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.96■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.95■■■□□ 2.07
SNX18-201ENST00000326277 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 ERC1Q8IUD2 1116 aa27.94■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.93■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 MCM4P33991 863 aa27.93■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.91■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.91■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.91■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 AK9Q5TCS8 1911 aa27.9■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.9■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 NBPF26B4DH59 902 aa27.9■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.9■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 NBPF14Q5TI25 921 aa27.9■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 NBPF15Q8N660 670 aa27.9■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 IL25Q9H293 177 aa27.9■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 ST18O60284 1047 aa27.89■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.89■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 CNTROBQ8N137 903 aa27.89■■■□□ 2.06
SNX18-201ENST00000326277 ERBB4Q15303 1308 aa27.88■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 PAPPAQ13219 1627 aa27.88■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 SASH1O94885 1247 aa27.88■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.88■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 MCCP23508 829 aa27.87■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.87■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.87■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.86■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 AACSQ86V21 672 aa27.86■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 PALD1Q9ULE6 856 aa27.85■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.85■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 SIL1Q9H173 461 aa27.85■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.84■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 GPATCH3Q96I76 525 aa27.84■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 BTG4Q9NY30 223 aa27.84■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 TNS2Q63HR2 1409 aa27.84■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 A1BGP04217 495 aa27.83■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 ANAPC15P60006 121 aa27.83■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
SNX18-201ENST00000326277 SGSM2O43147 1006 aa27.82■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.82■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 A0A087WZG4 1122 aa27.82■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 COL15A1P39059 1388 aa27.81■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 NEK4P51957 841 aa27.81■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.81■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 CASP7P55210 303 aa27.79■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 IL17RAQ96F46 866 aa27.79■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.79■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 COPRSQ9NQ92 184 aa27.79■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.78■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 HSPA4P34932 840 aa27.77■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.77■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 RAD50Q92878 1312 aa27.77■■■□□ 2.04
SNX18-201ENST00000326277 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 SSFA2P28290 1259 aa27.76■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 GBP4Q96PP9 640 aa27.76■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa27.76■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.75■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 EVI5LQ96CN4 794 aa27.75■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 H7C1W4 665 aa27.74■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 TRAK2O60296 914 aa27.74■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.74■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 PIGBQ92521 554 aa27.73■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 MCM2P49736 904 aa27.72■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.72■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 RUFY2Q8WXA3 655 aa27.72■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 TMX3Q96JJ7 454 aa27.72■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.72■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 DISP2A7MBM2 1401 aa27.71■■■□□ 2.03
SNX18-201ENST00000326277 FOXO4P98177 505 aa27.71■■■□□ 2.03
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