RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 PLIN1O60240 522 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 A1BGP04217 495 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 EVX2Q03828 476 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 NECTIN2Q92692 538 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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PDE4D-202ENST00000317118 KSR2Q6VAB6 950 aa7.49□□□□□ -1.21
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PDE4D-202ENST00000317118 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 APBA3O96018 575 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 MYL6BP14649 208 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-202ENST00000317118 ADCY9O60503 1353 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-202ENST00000317118 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-202ENST00000317118 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-202ENST00000317118 PANK1Q8TE04 598 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-202ENST00000317118 ALDH1L1O75891 902 aa7.46□□□□□ -1.21
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PDE4D-202ENST00000317118 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
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PDE4D-202ENST00000317118 LINS1Q8NG48 757 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 CRBNQ96SW2 442 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 COL15A1P39059 1388 aa7.46□□□□□ -1.22
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PDE4D-202ENST00000317118 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 FKBP8Q14318 412 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 COG6Q9Y2V7 657 aa7.45□□□□□ -1.22
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PDE4D-202ENST00000317118 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa7.45□□□□□ -1.22
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PDE4D-202ENST00000317118 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.45□□□□□ -1.22
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PDE4D-202ENST00000317118 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.44□□□□□ -1.22
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PDE4D-202ENST00000317118 GNPATO15228 680 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 CAMTA2O94983 1202 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 IGKV5-2P06315 115 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 KCNQ4P56696 695 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 TCIRG1Q13488 830 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-202ENST00000317118 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.44□□□□□ -1.22
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