RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 PIP4K2BP78356 416 aa22.68■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 USP26Q9BXU7 913 aa22.68■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 ERC2O15083 957 aa22.67■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 COPS6Q7L5N1 327 aa22.67■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 ADAMTS2O95450 1211 aa22.67■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.67■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 SLIT2O94813 1529 aa22.66■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.65■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.65■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 IGKV5-2P06315 115 aa22.65■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 RABEP1Q15276 862 aa22.65■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.65■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.65■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.65■■□□□ 1.22
HCLS1-201ENST00000314583 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 SUCLG2Q96I99 432 aa22.64■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.63■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 COL15A1P39059 1388 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF26B4DH59 902 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 GCKRQ14397 625 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF14Q5TI25 921 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF15Q8N660 670 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 MYD88Q99836 296 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 PIGBQ92521 554 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 EXOC5O00471 708 aa22.61■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.61■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 BCL9O00512 1426 aa22.61■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 RILPL2Q969X0 211 aa22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 KAZALD1Q96I82 304 aa22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 CHMLP26374 656 aa22.59■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.59■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.58■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 ATG3Q9NT62 314 aa22.58■■□□□ 1.21
HCLS1-201ENST00000314583 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 GPATCH3Q96I76 525 aa22.57■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.57■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 JCADQ9P266 1359 aa22.57■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 A1BGP04217 495 aa22.56■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 CNTROBQ8N137 903 aa22.56■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.56■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 MCCP23508 829 aa22.55■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 BARGINQ6ZT62 677 aa22.55■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 DDIT3P35638 169 aa22.54■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.53■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.53■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 TJP1Q07157 1748 aa22.52■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 ST18O60284 1047 aa22.52■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 DDB1Q16531 1140 aa22.52■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.52■■□□□ 1.2
HCLS1-201ENST00000314583 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 ANAPC15P60006 121 aa22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 IL27Q8NEV9 243 aa22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 COPRSQ9NQ92 184 aa22.5■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 A0A087WZG4 1122 aa22.49■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 SASH1O94885 1247 aa22.49■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 CASP7P55210 303 aa22.49■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.49■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 AACSQ86V21 672 aa22.49■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 IL17RAQ96F46 866 aa22.49■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.49■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.48■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.48■■□□□ 1.19
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