RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 RPS6KA4O75676 772 aa27.87■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 NEFLP07196 543 aa27.87■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 PDE3AQ14432 1141 aa27.87■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.86■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 COL15A1P39059 1388 aa27.86■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27.86■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.86■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 AKT1S1Q96B36 256 aa27.86■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 STK32BQ9NY57 414 aa27.86■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 SMIM5Q71RC9 77 aa27.85■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 ZNF827Q17R98 1081 aa27.84■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.84■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.84■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 MS4A1P11836 297 aa27.83■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.83■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 KSR2Q6VAB6 950 aa27.83■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 CRBNQ96SW2 442 aa27.83■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.83■■■□□ 2.05
STX4-201ENST00000313843 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.83■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.83■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 DNAAF4Q8WXU2 420 aa27.83■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 ARXQ96QS3 562 aa27.83■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 COG6Q9Y2V7 657 aa27.83■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 A0A087WZG4 1122 aa27.82■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 SLC15A2Q16348 729 aa27.82■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.82■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.82■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 PHF14O94880 888 aa27.81■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 FKBP8Q14318 412 aa27.81■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.81■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.81■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 ADRA2BP18089 450 aa27.8■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 SSFA2P28290 1259 aa27.8■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.8■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.8■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.8■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.8■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.78■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.78■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.78■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 ATP10DQ9P241 1426 aa27.78■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
STX4-201ENST00000313843 RFC4P35249 363 aa27.76■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 MYD88Q99836 296 aa27.76■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 HLFQ16534 295 aa27.74■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 BEND3Q5T5X7 828 aa27.74■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 MSH5O43196 834 aa27.73■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 ZPR1O75312 459 aa27.73■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 CAMTA2O94983 1202 aa27.73■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.72■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa27.72■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 NARFQ9UHQ1 456 aa27.72■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.71■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 NEXNQ0ZGT2 675 aa27.71■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.7■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 IGKV5-2P06315 115 aa27.7■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.7■■■□□ 2.03
STX4-201ENST00000313843 LINS1Q8NG48 757 aa27.7■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.69■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 NEURL1BA8MQ27 555 aa27.68■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 TCIRG1Q13488 830 aa27.68■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.68■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.68■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.68■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 ALDH1L1O75891 902 aa27.66■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 MEIS3Q99687 375 aa27.65■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.65■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.65■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 RGL2O15211 777 aa27.64■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 GPTP24298 496 aa27.64■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.64■■■□□ 2.02
STX4-201ENST00000313843 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.64■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 CASZ1Q86V15 1759 aa27.62■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 GYS1P13807 737 aa27.62■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 GCKRQ14397 625 aa27.62■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 USP44Q9H0E7 712 aa27.62■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.62■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.61■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.61■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.6■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.6■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms