RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 CAMTA2O94983 1202 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD4-201ENST00000306324 SLC4A2P04920 1241 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXD4-201ENST00000306324 FKBP8Q14318 412 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXD4-201ENST00000306324 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXD4-201ENST00000306324 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXD4-201ENST00000306324 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXD4-201ENST00000306324 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD4-201ENST00000306324 POLD1P28340 1107 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD4-201ENST00000306324 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.64■■■□□ 2.17
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HOXD4-201ENST00000306324 HLFQ16534 295 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 MMP10P09238 476 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 PTGER2P43116 358 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF428Q96B54 188 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 LRP5O75197 1615 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 G2E3Q7L622 706 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.61■■■□□ 2.17
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HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 NFIXQ14938 502 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.59■■■□□ 2.17
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HOXD4-201ENST00000306324 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.59■■■□□ 2.17
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HOXD4-201ENST00000306324 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD4-201ENST00000306324 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD4-201ENST00000306324 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
HOXD4-201ENST00000306324 DDR1Q08345 913 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD4-201ENST00000306324 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
HOXD4-201ENST00000306324 SETDB2Q96T68 719 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD4-201ENST00000306324 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
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HOXD4-201ENST00000306324 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
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HOXD4-201ENST00000306324 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD4-201ENST00000306324 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD4-201ENST00000306324 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.53■■■□□ 2.16
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HOXD4-201ENST00000306324 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.52■■■□□ 2.16
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXD4-201ENST00000306324 NPHP1O15259 732 aa28.48■■■□□ 2.15
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HOXD4-201ENST00000306324 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.47■■■□□ 2.15
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HOXD4-201ENST00000306324 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.46■■■□□ 2.15
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HOXD4-201ENST00000306324 F6X3S4 739 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXD4-201ENST00000306324 PARP10Q53GL7 1025 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXD4-201ENST00000306324 CNBD1Q8NA66 436 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRCP08575 1304 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXD4-201ENST00000306324 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.44■■■□□ 2.14
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HOXD4-201ENST00000306324 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.44■■■□□ 2.14
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HOXD4-201ENST00000306324 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
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HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.42■■■□□ 2.14
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HOXD4-201ENST00000306324 NYXQ9GZU5 481 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.41■■■□□ 2.14
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HOXD4-201ENST00000306324 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXD4-201ENST00000306324 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
HOXD4-201ENST00000306324 ST5P78524 1137 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXD4-201ENST00000306324 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXD4-201ENST00000306324 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
HOXD4-201ENST00000306324 NTSR2O95665 410 aa28.39■■■□□ 2.13
HOXD4-201ENST00000306324 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.39■■■□□ 2.13
HOXD4-201ENST00000306324 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.39■■■□□ 2.13
HOXD4-201ENST00000306324 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
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