RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304101.8

KCNS3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-201ENST00000304101 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 BARGINQ6ZT62 677 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 SSH3Q8TE77 659 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 REC8O95072 547 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 MX1P20591 662 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 RABEP1Q15276 862 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 BEND3Q5T5X7 828 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 FAM182BQ5T319 152 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 MCM4P33991 863 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 PDIA6Q15084 440 aa25.15■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 ADCY9O60503 1353 aa25.15■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 ERC2O15083 957 aa25.14■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 ATG3Q9NT62 314 aa25.14■■□□□ 1.62
KCNS3-201ENST00000304101 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.14■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 GLI3P10071 1580 aa25.14■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 POLA2Q14181 598 aa25.13■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.13■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.13■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.13■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 STAP2Q9UGK3 403 aa25.13■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 RAB11FIP3O75154 756 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 KCNQ2O43526 872 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 SRGAP3O43295 1099 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 AOX1Q06278 1338 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 ITGB4P16144 1822 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 BCL9O00512 1426 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 A1BGP04217 495 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 PAPPAQ13219 1627 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 HYPKQ9NX55 129 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 KSR2Q6VAB6 950 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNS3-201ENST00000304101 ALDH1L1O75891 902 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 NBPF26B4DH59 902 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 NBPF14Q5TI25 921 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 COPS6Q7L5N1 327 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 NBPF15Q8N660 670 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.06■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.06■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.06■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.06■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.06■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.05■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 RILPL2Q969X0 211 aa25.05■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.05■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.05■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.04■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 ST18O60284 1047 aa25.04■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.04■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 MTX1Q13505 466 aa25.03■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 CHMLP26374 656 aa25.03■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.02■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 GBP4Q96PP9 640 aa25.02■■□□□ 1.6
KCNS3-201ENST00000304101 ATRNO75882 1429 aa25.01■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 EP400Q96L91 3159 aa25■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 RIC3Q7Z5B4 369 aa25■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 LINS1Q8NG48 757 aa25■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 TRAK2O60296 914 aa25■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 SEPT12Q8IYM1 358 aa25■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.98■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 MCCP23508 829 aa24.98■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 KCNQ4P56696 695 aa24.98■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.98■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.97■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.97■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.97■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 ARXQ96QS3 562 aa24.96■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 GRM8O00222 908 aa24.96■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.96■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 MYD88Q99836 296 aa24.96■■□□□ 1.59
KCNS3-201ENST00000304101 UTYO14607 1347 aa24.95■■□□□ 1.58
KCNS3-201ENST00000304101 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.95■■□□□ 1.58
KCNS3-201ENST00000304101 AK9Q5TCS8 1911 aa24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms