RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298307.9

KLHDC2-201, Transcript of kelch domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KLHDC2, Length 5,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2-201ENST00000298307 MCM6Q14566 821 aa22.98■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 UBASH3AP57075 661 aa22.98■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.98■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.97■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.97■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 LIG1P18858 919 aa22.97■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 PAFAH1B1P43034 410 aa22.97■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 INCENPQ9NQS7 918 aa22.97■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 NEK1Q96PY6 1258 aa22.97■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 TDO2P48775 406 aa22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 NME9Q86XW9 330 aa22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 IQGAP2Q13576 1575 aa22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 FAM83GA6ND36 823 aa22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.96■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.95■■□□□ 1.27
KLHDC2-201ENST00000298307 DCTPP1Q9H773 170 aa22.95■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.95■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 CAPN2P17655 700 aa22.95■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 LUZP1Q86V48 1076 aa22.95■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 SYT1P21579 422 aa22.94■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 PIK3C2GO75747 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 HMGXB3Q12766 1538 aa22.94■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.93■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.93■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 CUL7Q14999 1698 aa22.93■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.93■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.93■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 PPFIA3O75145 1194 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 CCDC102BQ68D86 513 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 NESP48681 1621 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 GTF3C6Q969F1 213 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 TICAM2Q86XR7 235 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 CTAGE8P0CG41 777 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 ERO1AQ96HE7 468 aa22.92■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 TESK2Q96S53 571 aa22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 AK2P54819 239 aa22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 AIDAQ96BJ3 306 aa22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 GOLGA1Q92805 767 aa22.91■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 USP16Q9Y5T5 823 aa22.9■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.9■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.9■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.9■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 BRF1Q92994 677 aa22.9■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.9■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 SYKP43405 635 aa22.89■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 DNA2P51530 1060 aa22.89■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 SOGA3Q5TF21 947 aa22.89■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
KLHDC2-201ENST00000298307 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.89■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 CABP4P57796 275 aa22.88■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.88■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.88■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.88■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 VPS18Q9P253 973 aa22.88■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.88■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.87■■□□□ 1.25
KLHDC2-201ENST00000298307 ZNF213O14771 459 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms