RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281623.7

FBXO4-201, Transcript of F-box protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO4, Length 1,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4-201ENST00000281623 DCTPP1Q9H773 170 aa20.9■□□□□ 0.94
FBXO4-201ENST00000281623 C4BP0C0L5 1744 aa20.9■□□□□ 0.94
FBXO4-201ENST00000281623 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
FBXO4-201ENST00000281623 GNAI3P08754 354 aa20.89■□□□□ 0.94
FBXO4-201ENST00000281623 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
FBXO4-201ENST00000281623 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
FBXO4-201ENST00000281623 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.94
FBXO4-201ENST00000281623 HYPKQ9NX55 129 aa20.89■□□□□ 0.94
FBXO4-201ENST00000281623 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.89■□□□□ 0.94
FBXO4-201ENST00000281623 ATP6V1AP38606 617 aa20.89■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 PDIA6Q15084 440 aa20.89■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.89■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.89■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.88■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 GNAI2P04899 355 aa20.88■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.87■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 BEND3Q5T5X7 828 aa20.87■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.87■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 LNPKQ9C0E8 428 aa20.87■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.87■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.86■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.86■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 USP44Q9H0E7 712 aa20.86■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 ITPK1Q13572 414 aa20.86■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 NBPF14Q5TI25 921 aa20.86■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.85■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 HMMRO75330 724 aa20.84■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 KSR2Q6VAB6 950 aa20.84■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF827Q17R98 1081 aa20.83■□□□□ 0.93
FBXO4-201ENST00000281623 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.83■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 AKT1S1Q96B36 256 aa20.83■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.83■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 USP16Q9Y5T5 823 aa20.83■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.82■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 STK32BQ9NY57 414 aa20.82■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 ALDH1L1O75891 902 aa20.81■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 ATP8B2P98198 1209 aa20.8■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 SLC15A2Q16348 729 aa20.8■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.8■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 ERBB4Q15303 1308 aa20.79■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.79■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.79■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.79■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 MYL6BP14649 208 aa20.78■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 AK7Q96M32 723 aa20.78■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 CASZ1Q86V15 1759 aa20.78■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.77■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 MSH5O43196 834 aa20.77■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.77■□□□□ 0.92
FBXO4-201ENST00000281623 STARD3NLO95772 234 aa20.77■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 C4AP0C0L4 1744 aa20.76■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.76■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 COPS6Q7L5N1 327 aa20.76■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 LINS1Q8NG48 757 aa20.76■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.76■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.76■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 SMIM5Q71RC9 77 aa20.75■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 GNPATO15228 680 aa20.74■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 SSH3Q8TE77 659 aa20.74■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 UTYO14607 1347 aa20.74■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 SEC24BO95487 1268 aa20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 NBPF26B4DH59 902 aa20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 POLA2Q14181 598 aa20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 NBPF15Q8N660 670 aa20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 IGKV5-2P06315 115 aa20.72■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.72■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.72■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.71■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 RPS6KA4O75676 772 aa20.7■□□□□ 0.91
FBXO4-201ENST00000281623 SSFA2P28290 1259 aa20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.6 ms