RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 FMNL2Q96PY5 1086 aa12.96□□□□□ -0.33
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PRRX1-201ENST00000239461 CYP27B1O15528 508 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-201ENST00000239461 AACSQ86V21 672 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-201ENST00000239461 MCM2P49736 904 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-201ENST00000239461 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-201ENST00000239461 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
PRRX1-201ENST00000239461 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa12.83□□□□□ -0.35
PRRX1-201ENST00000239461 SIL1Q9H173 461 aa12.83□□□□□ -0.36
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