RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.61■■■□□ 2.17
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NME4-201ENST00000219479 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
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NME4-201ENST00000219479 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
NME4-201ENST00000219479 BCORQ6W2J9 1755 aa28.59■■■□□ 2.17
NME4-201ENST00000219479 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.59■■■□□ 2.17
NME4-201ENST00000219479 PCNTO95613 3336 aa28.59■■■□□ 2.17
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NME4-201ENST00000219479 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
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NME4-201ENST00000219479 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.55■■■□□ 2.16
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NME4-201ENST00000219479 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.54■■■□□ 2.16
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NME4-201ENST00000219479 C21orf2O43822 256 aa28.5■■■□□ 2.15
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NME4-201ENST00000219479 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
NME4-201ENST00000219479 POTECB2RU33 542 aa28.48■■■□□ 2.15
NME4-201ENST00000219479 CNBD1Q8NA66 436 aa28.48■■■□□ 2.15
NME4-201ENST00000219479 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.48■■■□□ 2.15
NME4-201ENST00000219479 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.47■■■□□ 2.15
NME4-201ENST00000219479 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.47■■■□□ 2.15
NME4-201ENST00000219479 NGEFQ8N5V2 710 aa28.46■■■□□ 2.15
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NME4-201ENST00000219479 ST5P78524 1137 aa28.44■■■□□ 2.14
NME4-201ENST00000219479 ERFEQ4G0M1 354 aa28.44■■■□□ 2.14
NME4-201ENST00000219479 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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NME4-201ENST00000219479 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.43■■■□□ 2.14
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NME4-201ENST00000219479 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.42■■■□□ 2.14
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NME4-201ENST00000219479 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
NME4-201ENST00000219479 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
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NME4-201ENST00000219479 ANP32CO43423 234 aa28.39■■■□□ 2.14
NME4-201ENST00000219479 MASTLQ96GX5 879 aa28.39■■■□□ 2.14
NME4-201ENST00000219479 APAF1O14727 1248 aa28.37■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 CHL1O00533 1208 aa28.36■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 HLFQ16534 295 aa28.36■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.36■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 FAM177BA6PVY3 158 aa28.35■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.35■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 SOGA3Q5TF21 947 aa28.35■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.35■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.34■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.34■■■□□ 2.13
NME4-201ENST00000219479 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
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NME4-201ENST00000219479 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 CFAP44Q96MT7 982 aa28.32■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 CHADLQ6NUI6 762 aa28.31■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 NPR1P16066 1061 aa28.3■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 CCDC184Q52MB2 194 aa28.3■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 CCDC93Q567U6 631 aa28.3■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 NYXQ9GZU5 481 aa28.3■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 MRS2Q9HD23 443 aa28.3■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 KRT24Q2M2I5 525 aa28.28■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 TNS4Q8IZW8 715 aa28.28■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 ANXA1P04083 346 aa28.27■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 GPTP24298 496 aa28.27■■■□□ 2.12
NME4-201ENST00000219479 PDIA6Q15084 440 aa28.27■■■□□ 2.12
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