RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DERL2Q9GZP9 239 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UBBP0CG47 229 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BPIP17213 487 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GNRHRP30968 328 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HOXD12P35452 270 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MLLT10P55197 1068 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FAM122AQ96E09 287 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HMCESQ96FZ2 354 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RBP7Q96R05 134 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GPR22Q99680 433 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ARL6Q9H0F7 186 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MTMR11A4FU01 709 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FAAHO00519 579 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RNF13O43567 381 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HTR3BO95264 441 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A25Q6T423 547 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SNX27Q96L92 541 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PKP4Q99569 1192 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CKAP5Q14008 2032 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NEMP2A6NFY4 417 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NUDT19A8MXV4 375 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LSMEM2Q8N112 164 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LGALS12Q96DT0 336 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HMX3A6NHT5 357 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NFKBIEO00221 500 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UPK1BO75841 260 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ALAS2P22557 587 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HLCSP50747 726 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PLGLB1Q02325 96 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DSC2Q02487 901 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TUSC3Q13454 348 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC10A1Q14973 349 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TRAM2Q15035 370 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UGT8Q16880 541 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NOXA1Q86UR1 476 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ACSS2Q9NR19 701 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CHEK1O14757 476 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SCO1O75880 301 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CD9P21926 228 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FABP6P51161 128 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EPHA4P54764 986 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CNTN2Q02246 1040 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FCRL5Q96RD9 977 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRKCAP17252 672 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CDK6Q00534 326 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RSU1Q15404 277 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 COQ5Q5HYK3 327 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR56A3Q8NH54 315 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SHDQ96IW2 340 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TTPALQ9BTX7 342 aa6.7□□□□□ -1.34
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