RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	C8G	P07360	202 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CAPN1	P07384	714 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	BMP2	P12643	396 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	MASP1	P48740	699 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	GNA13	Q14344	377 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	IFNE	Q86WN2	208 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	RNF175	Q8N4F7	328 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	COL26A1	Q96A83	441 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CD274	Q9NZQ7	290 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A1B0GTL3	188 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	HYKK	A2RU49	373 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR2A25	A4D2G3	310 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	DLGAP1	O14490	977 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	PFDN1	O60925	122 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	WDR47	O94967	919 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ERG	P11308	486 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CD1D	P15813	335 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	BCL6	P41182	706 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	EMP3	P54852	163 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDC20	Q12834	499 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	TGFBI	Q15582	683 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	PAQR7	Q86WK9	346 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	MIER2	Q8N344	545 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	C10orf90	Q96M02	699 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADI1	Q9BV57	179 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CMTM6	Q9NX76	183 aa		11.83	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	AZIN1	O14977	448 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR1F1	O43749	312 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	LINC00032	P0C843	101 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GFAP	P14136	432 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP4B	P51164	291 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CSNK1G2	P78368	415 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	C17orf64	Q86WR6	236 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TTC9	Q92623	222 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR2A5	Q96R48	311 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRIM64B	A6NI03	449 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TAPBP	O15533	448 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC6A2	P23975	617 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCL11	P51671	97 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	DIO3	P55073	304 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	UCN	P55089	124 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	NCF4	Q15080	339 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPS6KA2	Q15349	733 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPSM1	Q86YR5	675 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARPC2	O15144	300 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	MTHFD2	P13995	350 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRKACB	P22694	351 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAB8A	P61006	207 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP6V0D1	P61421	351 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	TUBA4A	P68366	448 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAP	Q12884	760 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF425	Q6IV72	752 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RABGEF1-209	ENST00000607882	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52

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