RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 PVRP15151 417 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 CYP11B2P19099 503 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV1-2P23083 117 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 HTR1EP28566 365 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAPK4P31152 587 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR1D4P47884 311 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 FHITP49789 147 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 LIG4P49917 911 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TIMM10P62072 90 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 KCTD2Q14681 263 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 EMC2Q15006 297 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 SNAPC1Q16533 368 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 EOGTQ5NDL2 527 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR52W1Q6IF63 320 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 SULT1C3Q6IMI6 304 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 UNC5DQ6UXZ4 953 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 NEGR1Q7Z3B1 354 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 KBTBD6Q86V97 674 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 CACUL1Q86Y37 369 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 UNC5CLQ8IV45 518 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM99Q8N816 258 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 Q8NDZ9 215 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR10G2Q8NGC3 310 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR4F5Q8NH21 305 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 CFAP61Q8NHU2 1237 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 C7orf33Q8WU49 177 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC35C1Q96A29 364 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PYCR2Q96C36 320 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PELI1Q96FA3 418 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM210BQ96KR6 192 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 MUS81Q96NY9 551 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 IL4I1Q96RQ9 567 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCM2Q9BSQ5 444 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 WWP1Q9H0M0 922 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TPK1Q9H3S4 243 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 APMAPQ9HDC9 416 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TBC1D7Q9P0N9 293 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PDP2Q9P2J9 529 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 GGA2Q9UJY4 613 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 SH3GLB1Q9Y371 365 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 LOC100509620A0A075B734 347 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPIAL4EA0A075B759 164 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 MACROD2A1Z1Q3 448 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 E5RGE8 158 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPIAL4DF5H284 164 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PSMD3O43242 534 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 AP5Z1O43299 807 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR6A2O95222 327 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 STAG3L1P0CL83 205 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPIAL4FP0DN26 164 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRT3P12035 628 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 HNF1AP20823 631 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 HOXD10P28358 340 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OTX2P32243 289 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSD17B3P37058 310 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR3A3P47888 321 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 ALDH3B2P48448 385 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 CSNK1DP48730 415 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 LIMK1P53667 647 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACTA1P68133 377 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 SULT2A1Q06520 285 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 DEFB116Q30KQ4 102 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 MS4A13Q5J8X5 152 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR2B11Q5JQS5 317 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACER2Q5QJU3 275 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 DNLZQ5SXM8 178 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 C17orf107Q6ZR85 190 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 GPR141Q7Z602 305 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 TIGD4Q8IY51 512 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 ELMOD1Q8N336 334 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 DUSP18Q8NEJ0 188 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR52P1PQ8NH57 321 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 STARD8Q92502 1023 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 DCUN1D4Q92564 292 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 P2RX5Q93086 422 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 PNPLA2Q96AD5 504 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB3CQ96E17 227 aa-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms