RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP21Q8N119 569 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM222BQ8WU58 562 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TANKQ92844 425 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ALPK1Q96QP1 1244 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG9Q9H6U8 611 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX24Q9Y343 169 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 NCKAP5O14513 1909 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 EPPINO95925 133 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RAP1GDS1P52306 607 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC37A1P57057 533 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB10P61026 200 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 NTRK2Q16620 822 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 GRHL2Q6ISB3 625 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF111Q6ZNA4 994 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HUS1BQ8NHY5 278 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RGMAQ96B86 450 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF597Q96LX8 424 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CPNE1Q99829 537 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT4Q9NZJ9 180 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNDC16Q9P2K2 825 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF11Q9UIL8 331 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 AHRRA9YTQ3 701 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QAP02745 245 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TACR1P25103 407 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 GP5P40197 560 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DGKQP52824 942 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH1Q08174 1060 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DLG1Q12959 904 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 BIKQ13323 160 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PAMR1Q6UXH9 720 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM64Q6YI46 380 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ISCA2Q86U28 154 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PYROXD1Q8WU10 500 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 UBTD2Q8WUN7 234 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKL2Q92772 493 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMP4Q99727 224 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 OPTCQ9UBM4 332 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 GLOD5A6NK44 160 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SUPT3HB4E1H0 165 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 K7EPI3 171 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 UBXN8O00124 270 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN12O43309 604 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10H2O60403 315 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SUPT3HO75486 399 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMP3P35625 211 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF136P52737 540 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM8P78325 824 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 BICRALQ6AI39 1079 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 LACC1Q8IV20 430 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF441Q8N8Z8 693 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 STAG3L4Q8TBR4 150 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 DIO2Q92813 273 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 RIT1Q92963 219 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD6Q96DN6 1003 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ATOH8Q96SQ7 321 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM159BA6NKW6 160 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS11DO60235 418 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 EEDO75530 441 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR75O95800 540 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXW4P57775 412 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CMC1Q7Z7K0 106 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 UCN3Q969E3 161 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC46Q96FV0 321 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SAYSD1Q9NPB0 183 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRE2Q9UHX3 823 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 EDARQ9UNE0 448 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB4Q9Y574 426 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP6Q13023 2319 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PR48 441 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PS29 197 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD33BA6NCL7 494 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6C76A6NM76 312 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 KERAO60938 352 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35E2BP0CK96 405 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3CBP42338 1070 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS13P62277 151 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TBCELQ5QJ74 424 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM198Q66K66 360 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPKQ9BS16 269 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM14Q9GZV8 571 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 UBQLN3Q9H347 655 aa23.49■■□□□ 1.35
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