RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ACKR1Q16570 336 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 C18orf63Q68DL7 685 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ISL2Q96A47 359 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 MARK4Q96L34 752 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 RILPQ96NA2 401 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 EGFL8Q99944 293 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 NT5DC2Q9H857 520 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CALHM2Q9HA72 323 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 LYRM4Q9HD34 91 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CR1P17927 2039 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 C2orf72A6NCS6 295 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 A8MXE2 369 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GNB5O14775 395 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SNPHO15079 494 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GNAZP19086 355 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CCKARP32238 428 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 MSH2P43246 934 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SLC37A1P57057 533 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 DOC2AQ14183 400 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SLC15A4Q8N697 577 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PIGTQ969N2 578 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 FBXL20Q96IG2 436 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 DGAT2Q96PD7 388 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CCL19Q99731 98 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 MS4A8Q9BY19 250 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 OARD1Q9Y530 152 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PSAT1Q9Y617 370 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TNFSF13O75888 250 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PGAM1P18669 254 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CPN2P22792 545 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PTPN6P29350 595 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CPA2P48052 419 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PTH2RP49190 550 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PRR22Q8IZ63 422 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 BBOF1Q8ND07 529 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TTLQ8NG68 377 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 USF3Q68DE3 2245 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 A0A088AWK7 358 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 RCBTB2O95199 551 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TGFB1P01137 390 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SERPINB3P29508 390 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SSTR4P31391 388 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CPOXP36551 454 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GMPRP36959 345 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PTGDSP41222 190 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CASP3P42574 277 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 STARP49675 285 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CDKL1Q00532 357 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SRYQ05066 204 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TOMM20Q15388 145 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF550Q7Z398 422 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 KRT78Q8N1N4 520 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CERS2Q96G23 380 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 MS4A14Q96JA4 679 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 A0A087X1B8 175 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CASKO14936 926 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SCELO95171 688 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TGM6O95932 706 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms