RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586312.5

PSME3-208, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 5

Gene PSME3, Length 752 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-208	ENST00000586312	SERTM1	A2A2V5	107 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	BIRC5	O15392	142 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TMPRSS11D	O60235	418 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	PRAMEF2	O60811	474 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	AIFM1	O95831	613 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	DRD2	P14416	443 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ID2	Q02363	134 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	INA	Q16352	499 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF766	Q5HY98	468 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	C18orf63	Q68DL7	685 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	BCORP1	Q8N888	145 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	NR4A3	Q92570	626 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	RIT1	Q92963	219 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	NCLN	Q969V3	563 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CCT7	Q99832	543 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	OLAH	Q9NV23	265 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ASB4	Q9Y574	426 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CENPE	Q02224	2701 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312		A0A1W2PR48	441 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	GLOD5	A6NK44	160 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	GABRR3	A8MPY1	467 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TYROBP	O43914	113 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	FGF17	O60258	216 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SEC22B	O75396	215 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	NEURL1	O76050	574 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	BPGM	P07738	259 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SLC35E2	P0CK97	266 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	GRK2	P25098	689 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	MAPK1	P28482	360 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SERPINB4	P48594	390 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CYB561	P49447	251 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	HMGCS1	Q01581	520 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SPINK14	Q6IE38	97 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	HDX	Q7Z353	690 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	KLHL29	Q96CT2	875 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SCMH1	Q96GD3	660 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	KCNA7	Q96RP8	456 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ACPT	Q9BZG2	426 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF225	Q9UK10	706 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312		A0A1B0GTL3	188 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	WDR91	A4D1P6	747 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM114	B3SHH9	223 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	RASAL1	O95294	804 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CLDN1	O95832	211 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SERPINE1	P05121	402 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	NT5E	P21589	574 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	GALNS	P34059	522 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SSR4	P51571	173 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	XK	P51811	444 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	KCNK10	P57789	538 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	MLF1	P58340	268 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CASP8	Q14790	479 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	OR1C1	Q15619	314 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms