RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578009.5

IFT20-205, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-205	ENST00000578009	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	MED8	Q96G25	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	APIP	Q96GX9	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	HBEGF	Q99075	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	ASF1A	Q9Y294	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	F5	P12259	2224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009		A0A1W2PQF6	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	RFXANK	O14593	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CLOCK	O15516	846 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	AKAP10	O43572	662 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	DPM1	O60762	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CREG1	O75629	220 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TIPRL	O75663	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	APBB3	O95704	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	IDS	P22304	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	NDUFS1	P28331	727 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	IGFALS	P35858	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	NUDT1	P36639	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	MAGEA8	P43361	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CCR8	P51685	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CHN2	P52757	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	WNT3	P56703	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	YPEL5	P62699	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CHRNB3	Q05901	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	RBBP4	Q09028	425 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PDE7A	Q13946	482 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PDK3	Q15120	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	IRF4	Q15306	451 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	UGT8	Q16880	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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